40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1885 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1885  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  201  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  0.020985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  66.67 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  66.67 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4596  hypothetical protein  75 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  39.58 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  39.18 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  43.75 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  36.71 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  40.28 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  44 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  45.21 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  35.44 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  39.51 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34.48 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  38.57 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  34.31 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.29 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  32.65 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1243  hypothetical protein  30.77 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.93 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.92 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1980  hypothetical protein  26.58 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  33.98 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  33.98 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  33.98 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  33.77 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  36.67 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4695  peptidase  35.59 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1476  peptidase  35.29 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000134436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  28.28 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3780  peptidase  31.03 
 
 		 248 aa  43.5  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0669086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0584  hypothetical protein  31.82 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00300104  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  26.14 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  26.14 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  26.14 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  27.27 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  32.32 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  29.35 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  25.88 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.88 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>