64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3432 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  100 
 
 		 105 aa  210  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  68.52 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  75 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  42.2 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  38.16 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  45.59 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  45.59 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  37.25 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.33 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  35.87 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  36 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  33 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  36.63 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  31.46 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1885  hypothetical protein  40.79 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  0.020985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  35.37 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.99 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  34.09 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  34.09 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  38.78 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  38.78 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  35.37 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  33.73 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  33.73 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  32.99 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  33.73 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4596  hypothetical protein  39.71 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  38.81 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  38.24 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  35 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  37.31 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  42.03 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.31 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  38.89 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  35.82 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  32.53 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3186  hypothetical protein  37.88 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  33 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  31.25 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  38.89 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  35.29 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  36.62 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  32 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3897  peptidase  36.71 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1980  hypothetical protein  29.33 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4695  peptidase  32.39 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0616  hypothetical protein  24.74 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414361  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0617  hypothetical protein  24.74 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000242002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3413  hypothetical protein  24.74 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000138823  normal  0.329766 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1243  hypothetical protein  26.44 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3780  peptidase  32.94 
 
 		 248 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0669086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3874  hypothetical protein  26.04 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000309341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3245  propeptide, PepSY amd peptidase M4  34.12 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000406601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3748  hypothetical protein  26.04 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0891426  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0577  hypothetical protein  26.04 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00197884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0623  hypothetical protein  26.76 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2934  peptidase  31.96 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00671564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  25.53 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3691  hypothetical protein  26.04 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4806  hypothetical protein  30 
 
 		 201 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325935  normal  0.738091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4515  hypothetical protein  40.35 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0560805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1133  peptidase  38.78 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  25 
 
 		 109 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>