56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2346 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  199  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  100 
 
 		 104 aa  199  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  95.19 
 
 		 104 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  93.27 
 
 		 104 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  66.33 
 
 		 101 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  64 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  62.24 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  66.67 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  66.67 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  72.84 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  47.22 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  59.18 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  47.96 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  47.96 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  48.42 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  46.74 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  45.1 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  43.75 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  41.24 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  41.77 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  41.25 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  39.18 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.3 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  40 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  46.05 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  32.58 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.78 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  46.05 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  41.79 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  37.35 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  37.35 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  36.49 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  35.48 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.49 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  36.14 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  36.49 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  31.63 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  33.65 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  35.14 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  40.3 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  35.29 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  34.57 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  35.62 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  37.68 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1243  hypothetical protein  36.99 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  36.11 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  30.38 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.56 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  31.11 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1980  hypothetical protein  29.49 
 
 		 128 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1885  hypothetical protein  33.77 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  0.020985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  32.53 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  32.53 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4515  hypothetical protein  39.44 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0560805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5445  hypothetical protein  30.26 
 
 		 138 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0704203  normal  0.135047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>