35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003783 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  100 
 
 		 141 aa  294  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  71.83 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1980  hypothetical protein  52.59 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1243  hypothetical protein  62.64 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  41.18 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  33.33 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.37 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  35.53 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  33.75 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  36 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1885  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  0.020985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  31.51 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.49 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.98 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  36.51 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  37.68 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  37.68 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  35.82 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  35.82 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  37.68 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  27.06 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  37.68 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4695  peptidase  40 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.8 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  32.35 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  32.35 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  34.21 
 
 		 88 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  28.24 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  28.24 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  29.41 
 
 		 88 aa  41.2  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.24 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  34.21 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  34.21 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  32.89 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  28.24 
 
 		 88 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>