43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4486 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  97.73 
 
 		 88 aa  173  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  96.59 
 
 		 88 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  96.59 
 
 		 88 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  94.32 
 
 		 88 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  93.18 
 
 		 88 aa  166  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  94.32 
 
 		 88 aa  166  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  93.18 
 
 		 88 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  90.91 
 
 		 88 aa  157  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  35.71 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.33 
 
 		 103 aa  57  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  41.79 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  38.36 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  34.15 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  41.79 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  41.79 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  36.84 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  41.79 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.53 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  37.31 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3186  hypothetical protein  29.85 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  42.62 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  42.62 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  34.33 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  32.31 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  35.37 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  35.37 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4806  hypothetical protein  29.33 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325935  normal  0.738091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  31.65 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3005  hypothetical protein  27.38 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000355724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  35 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  25.56 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.77 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  31.82 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.33 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  31.75 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  27.85 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  34.21 
 
 		 141 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  33.77 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  35.23 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  28.33 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  36.05 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>