12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4806 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4806  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  393  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325935  normal  0.738091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  29.33 
 
 
88 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  29.33 
 
 
88 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  29.33 
 
 
88 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  29.73 
 
 
88 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.73 
 
 
88 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  29.73 
 
 
88 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  29.33 
 
 
88 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  28.38 
 
 
88 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  29.73 
 
 
88 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  31.08 
 
 
101 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  30.99 
 
 
104 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>