78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0587 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  100 
 
 		 103 aa  204  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  57.65 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  42.72 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  40.21 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  39.36 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  38.3 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  38.3 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  39.81 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  40.48 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  35.63 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  39.81 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  35.63 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  35.63 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  44.26 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  38.24 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  44 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  37.11 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.63 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  34.48 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  34.48 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  37.93 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  33.33 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  42.67 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  31.73 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  57  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  36.08 
 
 		 102 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  35.82 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  34.33 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  35.48 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  35.29 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  33.33 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  32.29 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  38.67 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  36 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  41.58 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  35.06 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  32.67 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3019  peptidase  46.81 
 
 		 206 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  30.43 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  32.58 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  35.71 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3293  hypothetical protein  32.35 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196419  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  35.71 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  31.51 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  44.57 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  32.95 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0584  hypothetical protein  30.26 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00300104  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1885  hypothetical protein  36.07 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  0.020985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  32.95 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4596  hypothetical protein  35.09 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.33 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  38.81 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4393  hypothetical protein  27.72 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000355578  hitchhiker  0.0000221943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  44.57 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4695  peptidase  32.26 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  33.33 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  34.29 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  35.71 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  34.29 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0096  hypothetical protein  25.74 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000129427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0623  hypothetical protein  33.87 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3186  hypothetical protein  37.1 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3005  hypothetical protein  26.32 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000355724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0616  hypothetical protein  33.87 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414361  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3413  hypothetical protein  33.87 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000138823  normal  0.329766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0617  hypothetical protein  33.87 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000242002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3874  hypothetical protein  34.43 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000309341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3691  hypothetical protein  34.43 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0577  hypothetical protein  34.43 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00197884  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3748  hypothetical protein  34.43 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0891426  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0422  propeptide PepSY amd peptidase M4  29.59 
 
 		 173 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0789  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.871184  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  38.98 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  38.98 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3687  peptidase  29.27 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.075913  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4784  hypothetical protein  24.73 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000553025  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>