44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3764 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  100 
 
 		 96 aa  182  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  40.4 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  38.38 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  39.08 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  39.56 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.58 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  47.47 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  47.47 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  32.58 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  32.58 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  32.58 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  32.58 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  44.68 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  31.46 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  32.58 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  32.58 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  44.32 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  44.32 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  50.62 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  44.32 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  41.24 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  32.58 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  46.25 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  45.12 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  45.12 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  41.18 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  35.05 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  43.3 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  40.26 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  37.14 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3897  peptidase  30.34 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  38.24 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.81 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  31.25 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0927  peptidase  37.5 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  32.65 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3186  hypothetical protein  39.39 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0422  propeptide PepSY amd peptidase M4  37.5 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1861  peptidase  42.86 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.746884  normal  0.0400575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2974  peptidase  42.86 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.577103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  36.26 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  36.26 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0935  peptidase  40.91 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.088972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3780  peptidase  33.33 
 
 		 248 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0669086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>