13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0927 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0927  peptidase  100 
 
 		 117 aa  239  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3897  peptidase  37.84 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4646  hypothetical protein  45.28 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3816  peptidase  45.28 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134174  hitchhiker  0.00511422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3907  peptidase  45.28 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000603836  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4024  peptidase  45.28 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3302  hypothetical protein  48.33 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  37.5 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4343  peptidase  30.84 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000216111  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3851  peptidase  36.36 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4211  peptidase  38.71 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000802331  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4139  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.71 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0676488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  28.97 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>