20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4139 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4139  Propeptide PepSY amd peptidase M4  100 
 
 
96 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0676488  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4343  peptidase  98.96 
 
 
96 aa  190  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000216111  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4211  peptidase  98.96 
 
 
96 aa  189  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000802331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3816  peptidase  84 
 
 
100 aa  167  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134174  hitchhiker  0.00511422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3907  peptidase  84 
 
 
100 aa  167  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000603836  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4024  peptidase  84 
 
 
100 aa  167  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3851  peptidase  81 
 
 
100 aa  161  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4646  hypothetical protein  82 
 
 
99 aa  155  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3245  propeptide, PepSY amd peptidase M4  44.44 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000406601  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2934  peptidase  60 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00671564  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1265  peptidase  42.48 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241223  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3379  peptidase  43.24 
 
 
111 aa  72  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000025517  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1133  peptidase  59.02 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3302  hypothetical protein  45.36 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2694  peptidase  51.52 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000037509  normal  0.0940789 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0283  hypothetical protein  37.76 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1387  hypothetical protein  31.11 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0927  peptidase  38.71 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3352  hypothetical protein  52.08 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000394447  normal  0.0556359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2506  propeptide, PepSY amd peptidase M4  46 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.380637  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>