47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4596 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4596  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  188  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  84.38 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  84.38 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1885  hypothetical protein  75.61 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  0.020985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  38.24 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  39.6 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  39.47 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  37.11 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  36.19 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  43.04 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  41.77 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  39.36 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  31.68 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  38.71 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4695  peptidase  38.71 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.35 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.23 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  29.79 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  32.43 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34.43 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  31.08 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.65 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  29.21 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  33.65 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  30.1 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  33.65 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  33.65 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1980  hypothetical protein  26.25 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  34.18 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0908  peptidase  31.25 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1052  peptidase  31.25 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.92611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  38.46 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  38.46 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  32.29 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  29.9 
 
 		 102 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3748  hypothetical protein  23.4 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0891426  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0577  hypothetical protein  23.4 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00197884  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3874  hypothetical protein  23.4 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000309341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1243  hypothetical protein  27.03 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3691  hypothetical protein  23.4 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.03 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0623  hypothetical protein  23.71 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0617  hypothetical protein  22.68 
 
 		 115 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000242002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3413  hypothetical protein  22.68 
 
 		 115 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000138823  normal  0.329766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0616  hypothetical protein  22.68 
 
 		 115 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414361  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  27.03 
 
 		 88 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>