33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1993 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  61.76 
 
 		 102 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  61.76 
 
 		 102 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  62.75 
 
 		 102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  60.82 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  53 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  48.51 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  53.75 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  52.94 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  54.43 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  53.75 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  51.76 
 
 		 106 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  38.83 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  46.74 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  46.74 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  46.74 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  39.6 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  40.43 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  41.77 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  40 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  38.14 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  46.25 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  35.29 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  43.27 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  45.65 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  41.84 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  48.15 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.67 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  33.33 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.36 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1138  hypothetical protein  28.81 
 
 		 188 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  41.67 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4930  hypothetical protein  31.48 
 
 		 148 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.325685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>