26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1609 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  209  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  76.47 
 
 		 102 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  50.98 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  50.98 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  48.04 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  47.06 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  47.52 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  42.72 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  43.56 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  39.22 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  43.75 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  43.04 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  41.25 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  39.58 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  38.75 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  32.65 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  32.35 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  33.33 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  33.33 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  30.93 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  30.93 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  28.12 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  30.61 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  27.88 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  28.42 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  27.85 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>