14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2241 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2241  peptidase  100 
 
 		 117 aa  228  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2240  hypothetical protein  60.18 
 
 		 110 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0370067  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  32.41 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1922  peptidase  39.68 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1967  peptidase propeptide/YPEB domain-containing protein  36.84 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0253954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0228  peptidase  31.87 
 
 		 274 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  45.83 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  45.83 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  29.63 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  40.32 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  32.26 
 
 		 102 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3471  peptidase  41.54 
 
 		 109 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0544  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.53 
 
 		 287 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.468149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  37.5 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>