18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0281 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0281  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  353  5e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000237407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0280  hypothetical protein  98.84 
 
 		 173 aa  350  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3741  hypothetical protein  98.84 
 
 		 173 aa  350  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4429  hypothetical protein  94.8 
 
 		 173 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0396  hypothetical protein  87.86 
 
 		 173 aa  320  8e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0297  hypothetical protein  86.13 
 
 		 173 aa  310  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0293  hypothetical protein  86.13 
 
 		 173 aa  310  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0285  hypothetical protein  86.13 
 
 		 173 aa  310  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0292  hypothetical protein  85.55 
 
 		 173 aa  309  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922052  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3533  hypothetical protein  45.66 
 
 		 174 aa  175  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0096  hypothetical protein  46.63 
 
 		 178 aa  170  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000129427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0089  hypothetical protein  45.56 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4111  hypothetical protein  43.93 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4393  hypothetical protein  44.94 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000355578  hitchhiker  0.0000221943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0108  hypothetical protein  46.15 
 
 		 176 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000003316  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4784  hypothetical protein  42.7 
 
 		 178 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000553025  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  31.75 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0420  hypothetical protein  20 
 
 		 202 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.183969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>