19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0096 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0096  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  358  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000129427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4393  hypothetical protein  66.29 
 
 		 178 aa  244  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000355578  hitchhiker  0.0000221943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4784  hypothetical protein  62.92 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000553025  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0281  hypothetical protein  46.63 
 
 		 173 aa  170  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000237407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0280  hypothetical protein  46.07 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3741  hypothetical protein  46.07 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0396  hypothetical protein  44.94 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4429  hypothetical protein  44.94 
 
 		 173 aa  165  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0297  hypothetical protein  45.51 
 
 		 173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0292  hypothetical protein  44.38 
 
 		 173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0285  hypothetical protein  45.51 
 
 		 173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0293  hypothetical protein  45.51 
 
 		 173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4111  hypothetical protein  46.63 
 
 		 173 aa  164  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3533  hypothetical protein  41.57 
 
 		 174 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0089  hypothetical protein  40.45 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0108  hypothetical protein  42.68 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000003316  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2497  peptidase  27.74 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.74 
 
 		 103 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0422  propeptide PepSY amd peptidase M4  29.31 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>