14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3687 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3687  peptidase  100 
 
 		 181 aa  364  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.075913  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2497  peptidase  31.25 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1922  peptidase  35.43 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  32.22 
 
 		 104 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3968  peptidase  28.89 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0247795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4336  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.89 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.188591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4448  propeptide PepSY amd peptidase M4  28.06 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345934  normal  0.288379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  38.98 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3019  peptidase  28.57 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1353  peptidase  30.12 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.382805  normal  0.0680656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  31.58 
 
 		 103 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0096  hypothetical protein  24.36 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000129427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  27.72 
 
 		 103 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  34.38 
 
 		 101 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>