9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5445 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5445  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  265  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0704203  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  38.33 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3019  peptidase  32.35 
 
 		 206 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  38.71 
 
 		 103 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2241  peptidase  38.71 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  28.95 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  30.26 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  30.26 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  30.26 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>