89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2117 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  61.8 
 
 
89 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  65.17 
 
 
89 aa  117  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  59.55 
 
 
89 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  59.09 
 
 
93 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  54.55 
 
 
94 aa  104  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  54.55 
 
 
93 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  55.06 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  52.27 
 
 
99 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  54.44 
 
 
90 aa  98.2  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  48.86 
 
 
92 aa  94.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  51.72 
 
 
95 aa  93.6  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  48.89 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  48.31 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  47.78 
 
 
90 aa  92.8  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  51.11 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  47.78 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  52.22 
 
 
90 aa  92  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  47.78 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  48.86 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  51.11 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  51.11 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  48.89 
 
 
90 aa  89  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  46.67 
 
 
90 aa  89  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  51.06 
 
 
90 aa  89  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  42.7 
 
 
87 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  50 
 
 
112 aa  86.7  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  46.67 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  42.53 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  45.45 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  45.56 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  44.32 
 
 
92 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  43.02 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  41.57 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  44.94 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  41.57 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  42.7 
 
 
88 aa  72  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  48.86 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  41.38 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  38.2 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  37.08 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  40.7 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  44.71 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  40.54 
 
 
324 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  39.19 
 
 
327 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  38.96 
 
 
325 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  40.51 
 
 
165 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  35.14 
 
 
316 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  36.99 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  30.59 
 
 
400 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  36.49 
 
 
317 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  33.78 
 
 
316 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  40.98 
 
 
429 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.16 
 
 
183 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  40.91 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  40.91 
 
 
404 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  37.88 
 
 
429 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  30.43 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  39.39 
 
 
418 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  40.98 
 
 
418 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  46.94 
 
 
183 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  37.88 
 
 
404 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  38.36 
 
 
189 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  27.69 
 
 
183 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  28.21 
 
 
398 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  34.85 
 
 
415 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  34.85 
 
 
404 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  39.34 
 
 
412 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  30.86 
 
 
409 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  34.85 
 
 
404 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.67 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  30.67 
 
 
421 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  32.43 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.67 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  34.85 
 
 
173 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  28 
 
 
414 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  36.17 
 
 
405 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  30.61 
 
 
196 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  32.69 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  35.85 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  32.69 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  33.33 
 
 
410 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.21 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  37.88 
 
 
411 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  40.91 
 
 
188 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  33.33 
 
 
410 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.64 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>