More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2645 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  100 
 
 
316 aa  633  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  91.46 
 
 
316 aa  586  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  75.16 
 
 
324 aa  476  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  70.79 
 
 
317 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  66.23 
 
 
325 aa  409  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  66.13 
 
 
327 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0223  formyl transferase domain-containing protein  41.49 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  38.83 
 
 
300 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  40.14 
 
 
286 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  39.19 
 
 
287 aa  188  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  39.58 
 
 
286 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  39.42 
 
 
288 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1008  tRNA nucleotidyltransferase/formyltetrahydrofolate deformylase  37.14 
 
 
644 aa  186  3e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00246463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  38.87 
 
 
287 aa  185  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  39.29 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0811  formyltetrahydrofolate deformylase  35.34 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.245806  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  38.46 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  39.8 
 
 
286 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1220  formyltetrahydrofolate deformylase  35.34 
 
 
274 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  39.8 
 
 
286 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  37.59 
 
 
288 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1249  formyltetrahydrofolate deformylase  35.4 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3669  formyltetrahydrofolate deformylase  38.32 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0400805  normal  0.143987 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0881  formyltetrahydrofolate deformylase  34.98 
 
 
274 aa  180  4e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1343  formyltetrahydrofolate deformylase  38.85 
 
 
316 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0822  formyltetrahydrofolate deformylase  38.24 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.837326  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1134  formyltetrahydrofolate deformylase  40.96 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.409656  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1445  formyltetrahydrofolate deformylase  37.91 
 
 
288 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  36.07 
 
 
284 aa  179  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1476  formyltetrahydrofolate deformylase  37.91 
 
 
288 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1440  formyltetrahydrofolate deformylase  37.91 
 
 
288 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2907  formyltetrahydrofolate deformylase  37.91 
 
 
291 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.520596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  36.39 
 
 
306 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.657774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  40.57 
 
 
299 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  38.35 
 
 
300 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1370  formyltetrahydrofolate deformylase  36.82 
 
 
317 aa  177  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3999  formyltetrahydrofolate deformylase  39.01 
 
 
274 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  38.3 
 
 
285 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  33.8 
 
 
285 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  38.46 
 
 
283 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  35.99 
 
 
287 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  36.14 
 
 
284 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  36.14 
 
 
284 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  36.14 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  37.05 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  36.84 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01373  formyltetrahydrofolate deformylase  34.44 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  37.04 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004096  formyltetrahydrofolate deformylase  34.07 
 
 
277 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0262931  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  37.5 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  39.07 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2821  formyltetrahydrofolate deformylase  37.18 
 
 
300 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  38.43 
 
 
283 aa  172  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2647  formyltetrahydrofolate deformylase  37.18 
 
 
300 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2714  formyltetrahydrofolate deformylase  37.18 
 
 
300 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  37.32 
 
 
282 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3462  formyltetrahydrofolate deformylase  38.79 
 
 
306 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  34.81 
 
 
278 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2713  formyltetrahydrofolate deformylase  36.82 
 
 
282 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  hitchhiker  0.00024588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  37.68 
 
 
295 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  37.06 
 
 
289 aa  169  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4357  formyltetrahydrofolate deformylase  35.66 
 
 
286 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.578575  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  37.87 
 
 
292 aa  169  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1971  formyltetrahydrofolate deformylase  37.23 
 
 
282 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0499985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  33.57 
 
 
282 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  34.88 
 
 
288 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1624  formyltetrahydrofolate deformylase  35.38 
 
 
271 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2334  formyltetrahydrofolate deformylase  36.82 
 
 
282 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000680969  normal  0.0350893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  32.73 
 
 
282 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2080  formyltetrahydrofolate deformylase  36.82 
 
 
282 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0789639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  33.7 
 
 
284 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  37.09 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2891  formyltetrahydrofolate deformylase  35.71 
 
 
283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1962  formyltetrahydrofolate deformylase  37.41 
 
 
282 aa  165  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  35.09 
 
 
284 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1577  formyltetrahydrofolate deformylase  35.06 
 
 
277 aa  165  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200981  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  35.64 
 
 
289 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  36.19 
 
 
284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  35.9 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3286  formyltetrahydrofolate deformylase  33.7 
 
 
277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647235  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1717  formyltetrahydrofolate deformylase  36.2 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183504  normal  0.737156 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  35.03 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  36.21 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01208  formyltetrahydrofolate deformylase  36.2 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2417  formyltetrahydrofolate deformylase  36.2 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875082  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  36.23 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01218  hypothetical protein  36.2 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1381  formyltetrahydrofolate deformylase  36.2 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0534896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  35.37 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1976  formyltetrahydrofolate deformylase  35.23 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1909  formyltetrahydrofolate deformylase  36.2 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0165731  normal  0.142161 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  35.86 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1340  formyltetrahydrofolate deformylase  36.2 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00174787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2395  formyltetrahydrofolate deformylase  36.2 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  37.32 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1397  formyltetrahydrofolate deformylase  36.2 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  34.74 
 
 
284 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1549  formyltetrahydrofolate deformylase  35.74 
 
 
285 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  34.35 
 
 
294 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  34.35 
 
 
294 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>