More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2326 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
284 aa  587  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  56.83 
 
 
289 aa  347  9e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 
296 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
284 aa  315  6e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
309 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
284 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
284 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 
284 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  51.08 
 
 
287 aa  305  6e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  53.57 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 
286 aa  300  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
284 aa  298  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
284 aa  298  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 
287 aa  298  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 
287 aa  297  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 
284 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  51.08 
 
 
288 aa  294  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
296 aa  294  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
285 aa  292  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 
292 aa  292  5e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 
288 aa  288  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 
293 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 
299 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
286 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
286 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 
287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
300 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  47.02 
 
 
284 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  47.16 
 
 
296 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  47.72 
 
 
284 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
284 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  45.88 
 
 
288 aa  277  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  47.04 
 
 
284 aa  276  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
283 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  47.16 
 
 
286 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 
289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 
284 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 
295 aa  271  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  46.5 
 
 
286 aa  271  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 
282 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 
284 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 
282 aa  269  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 
289 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  45.94 
 
 
283 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  44.48 
 
 
285 aa  267  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  46.29 
 
 
283 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  46.29 
 
 
283 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  46.59 
 
 
289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  45.77 
 
 
283 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  45.94 
 
 
283 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  45.45 
 
 
284 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  46.57 
 
 
287 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 
307 aa  263  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  44.48 
 
 
299 aa  263  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  46.18 
 
 
284 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  46.18 
 
 
284 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 
303 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  43.46 
 
 
284 aa  262  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  43.46 
 
 
283 aa  262  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  44.21 
 
 
316 aa  262  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 
289 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 
287 aa  261  6.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  44.01 
 
 
283 aa  261  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  45.68 
 
 
285 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  45.32 
 
 
284 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 
310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  42.76 
 
 
282 aa  258  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  45.23 
 
 
294 aa  258  9e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  45.23 
 
 
294 aa  258  9e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  44.13 
 
 
293 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  43.66 
 
 
291 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  47.08 
 
 
290 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 
282 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 
282 aa  256  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  44.88 
 
 
282 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  46.35 
 
 
284 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  43.46 
 
 
294 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  47.31 
 
 
297 aa  256  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  45.32 
 
 
282 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  44.88 
 
 
287 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  41.75 
 
 
292 aa  255  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  41.44 
 
 
295 aa  255  7e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  43.88 
 
 
283 aa  254  9e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  42.66 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  45.68 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  45.99 
 
 
284 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  44.73 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  43.88 
 
 
282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 
288 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 
291 aa  253  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  44.24 
 
 
282 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  43.82 
 
 
294 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>