More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2199 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  82.23 
 
 		 287 aa  485  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  72.76 
 
 		 288 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  69.44 
 
 		 293 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  69.64 
 
 		 292 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  66.31 
 
 		 309 aa  387  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 		 289 aa  328  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  53.52 
 
 		 284 aa  325  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 		 287 aa  318  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  51.94 
 
 		 284 aa  318  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  52.1 
 
 		 284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  51.39 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  51.96 
 
 		 284 aa  309  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  55.59 
 
 		 286 aa  308  5e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  52.08 
 
 		 300 aa  308  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 296 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 287 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  52.16 
 
 		 283 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  51.6 
 
 		 286 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  51.6 
 
 		 286 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  51.08 
 
 		 284 aa  294  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  53.43 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 284 aa  293  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 		 289 aa  286  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  51.99 
 
 		 296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 284 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 		 286 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 288 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 287 aa  279  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 		 295 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  48.6 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 283 aa  275  8e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 		 290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  46.15 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  48.78 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 		 284 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  47.87 
 
 		 285 aa  271  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  47.54 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 		 286 aa  269  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 		 282 aa  269  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  45.32 
 
 		 285 aa  269  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 		 283 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 		 283 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 283 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 		 283 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 		 283 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 289 aa  268  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 284 aa  268  7e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 		 299 aa  267  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 287 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  47.65 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 		 282 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  45.68 
 
 		 284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  48.01 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 		 284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 284 aa  265  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  45.68 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 		 289 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 		 282 aa  265  8.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  45.1 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  44.41 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  46.62 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0748  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.811069  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  47.35 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  45.68 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 		 282 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  45.16 
 
 		 286 aa  262  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 		 284 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 		 290 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 		 284 aa  261  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  45.64 
 
 		 294 aa  261  6.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  45.04 
 
 		 282 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 285 aa  261  8e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  46.5 
 
 		 289 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  45.49 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  43.3 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  44.24 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  45.02 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  46.62 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  45.16 
 
 		 287 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>