More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1488 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  65.48 
 
 
287 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  65.14 
 
 
295 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  63.12 
 
 
287 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  62.19 
 
 
286 aa  355  5.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  61.13 
 
 
289 aa  352  5e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  59.43 
 
 
286 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  59.43 
 
 
286 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  57.29 
 
 
299 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  59.79 
 
 
286 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  59.07 
 
 
300 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  57.89 
 
 
295 aa  333  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  57.95 
 
 
300 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  58.25 
 
 
295 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  60.99 
 
 
299 aa  332  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  56.12 
 
 
294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 
284 aa  325  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  54.3 
 
 
296 aa  323  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  58.06 
 
 
310 aa  322  6e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 
284 aa  319  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  53.64 
 
 
307 aa  317  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  55.91 
 
 
283 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  54.77 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  57.8 
 
 
289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  54.06 
 
 
284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 
284 aa  312  5.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  58.21 
 
 
291 aa  312  5.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  56.18 
 
 
290 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  56.54 
 
 
287 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  55.91 
 
 
287 aa  305  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  52.31 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  56.23 
 
 
297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  53.15 
 
 
293 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 
292 aa  299  5e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 
283 aa  298  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
287 aa  298  6e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  54.48 
 
 
296 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
284 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
288 aa  296  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
284 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 
282 aa  295  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  48.78 
 
 
288 aa  295  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 
283 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 
283 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 
283 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
284 aa  294  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 
282 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 
283 aa  292  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 
283 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  54.93 
 
 
283 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  54.84 
 
 
288 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 
283 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 
283 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 
283 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 
285 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  52.43 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 
283 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  51.58 
 
 
294 aa  282  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  51.58 
 
 
294 aa  282  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 
287 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 
282 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 
284 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 
282 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  45.96 
 
 
284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  51.24 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 
284 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
291 aa  272  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
287 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  47.55 
 
 
289 aa  269  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
294 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 
282 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2094  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 
298 aa  268  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689957  normal  0.0344586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 
282 aa  268  8e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  51.96 
 
 
287 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 
293 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 
282 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  47.9 
 
 
287 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
294 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  48.04 
 
 
297 aa  267  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  48.78 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  49.48 
 
 
286 aa  265  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 
285 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 
294 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  47.46 
 
 
307 aa  265  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
298 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  51.23 
 
 
282 aa  265  8.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  45.58 
 
 
284 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  45.55 
 
 
292 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 
282 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  51.94 
 
 
285 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 
294 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 
294 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 
280 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  46.29 
 
 
284 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  44.88 
 
 
284 aa  262  4e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>