More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2434 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
296 aa  610  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  63.73 
 
 
284 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 
284 aa  345  7e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  56.58 
 
 
284 aa  341  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 
284 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 
284 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 
284 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  56.99 
 
 
289 aa  331  7.000000000000001e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 
284 aa  330  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  55.44 
 
 
287 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 
284 aa  328  6e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  54.3 
 
 
296 aa  323  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  52.05 
 
 
300 aa  321  8e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  51.58 
 
 
288 aa  321  9.000000000000001e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  55.48 
 
 
286 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  51.96 
 
 
283 aa  318  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 
287 aa  318  5e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  51.71 
 
 
300 aa  318  9e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  51.96 
 
 
283 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  51.76 
 
 
283 aa  317  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  53.24 
 
 
288 aa  315  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  53.55 
 
 
287 aa  314  9e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  51.76 
 
 
294 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  53.76 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  51.08 
 
 
287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
283 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  52.31 
 
 
293 aa  311  5.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 
299 aa  310  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
292 aa  310  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 
284 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
283 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
283 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
283 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
283 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 
286 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 
286 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 
290 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  51.55 
 
 
295 aa  305  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 
307 aa  305  6e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 
283 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  52.28 
 
 
287 aa  305  9.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  51.93 
 
 
285 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
283 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  52.98 
 
 
289 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 
288 aa  301  6.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 
282 aa  299  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
283 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
286 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 
296 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  51.08 
 
 
287 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  47.89 
 
 
285 aa  293  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  49.66 
 
 
297 aa  291  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 
294 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  48.1 
 
 
284 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 
310 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  48.44 
 
 
284 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
284 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
294 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
294 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 
289 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  53.07 
 
 
302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  288  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
291 aa  287  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
287 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
294 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  46.45 
 
 
286 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  48.2 
 
 
297 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
299 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
289 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
294 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 
303 aa  285  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 
288 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  51.08 
 
 
284 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
287 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  45.94 
 
 
284 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  46.48 
 
 
284 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 
287 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 
282 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 
284 aa  281  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
287 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 
291 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 
288 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 
284 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 
280 aa  278  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 
295 aa  278  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 
287 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 
284 aa  278  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  48.77 
 
 
307 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>