More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1020 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
284 aa  593  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  74.38 
 
 
283 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  74.38 
 
 
283 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  74.38 
 
 
283 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  74.38 
 
 
283 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  73.67 
 
 
283 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  73.57 
 
 
283 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  72.24 
 
 
283 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  72.14 
 
 
283 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  72.5 
 
 
282 aa  441  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  72.6 
 
 
283 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  72.6 
 
 
283 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  66.31 
 
 
290 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  65.14 
 
 
285 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  61.48 
 
 
283 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  62.54 
 
 
288 aa  391  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  64.52 
 
 
287 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  65.36 
 
 
286 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  61.13 
 
 
284 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  61.97 
 
 
291 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  61.21 
 
 
296 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  63.93 
 
 
289 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  63.44 
 
 
287 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  58.3 
 
 
282 aa  359  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  54.36 
 
 
291 aa  345  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  56.03 
 
 
316 aa  342  5.999999999999999e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  58.27 
 
 
267 aa  335  7e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  53.87 
 
 
292 aa  333  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3654  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 
290 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 
284 aa  319  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4965  formyltetrahydrofolate deformylase  51.23 
 
 
289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 
296 aa  310  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 
283 aa  308  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 
303 aa  301  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 
286 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  53.52 
 
 
287 aa  298  7e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 
287 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 
282 aa  296  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 
287 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
290 aa  296  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  52.3 
 
 
300 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  52.65 
 
 
300 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 
287 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  51.6 
 
 
293 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 
287 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
294 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
294 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
294 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  48.24 
 
 
284 aa  290  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
291 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  51.99 
 
 
288 aa  290  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  48.41 
 
 
284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  48.41 
 
 
284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 
297 aa  288  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  288  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 
282 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 
282 aa  287  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  51.62 
 
 
294 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 
294 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 
294 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 
298 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 
284 aa  285  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
284 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
280 aa  285  8e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
284 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
287 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
296 aa  284  9e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
287 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
294 aa  282  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 
289 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  48.26 
 
 
282 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
295 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 
302 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
281 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 
294 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
284 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  48.59 
 
 
284 aa  279  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
282 aa  278  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 
283 aa  278  8e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  47.54 
 
 
292 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
282 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
289 aa  277  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 
282 aa  277  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 
287 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  47.89 
 
 
284 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 
287 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  48.77 
 
 
283 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 
292 aa  275  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 
292 aa  275  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  47.37 
 
 
289 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  48.2 
 
 
283 aa  275  9e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>