More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3654 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3654  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 290 aa  588  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  75.52 
 
 		 316 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  68.99 
 
 		 291 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  68.14 
 
 		 292 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4965  formyltetrahydrofolate deformylase  59.31 
 
 		 289 aa  354  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  56.94 
 
 		 287 aa  342  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  58.62 
 
 		 289 aa  341  9e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 		 282 aa  338  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  58.66 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  58.66 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  58.3 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  58.66 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  56.12 
 
 		 291 aa  335  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 		 283 aa  332  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  58.3 
 
 		 290 aa  332  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  57.95 
 
 		 283 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  57.75 
 
 		 288 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  57.6 
 
 		 283 aa  328  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  56.18 
 
 		 283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  56.18 
 
 		 287 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  56.18 
 
 		 283 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  56.18 
 
 		 283 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 		 284 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  54.06 
 
 		 285 aa  318  6e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  54.83 
 
 		 296 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  52.82 
 
 		 282 aa  316  3e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  52.43 
 
 		 286 aa  308  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  51.55 
 
 		 284 aa  300  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 284 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 283 aa  298  9e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 267 aa  281  8.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  52.46 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  52.11 
 
 		 282 aa  278  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 		 297 aa  278  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  50.34 
 
 		 289 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 		 300 aa  271  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  50.86 
 
 		 295 aa  271  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  47.46 
 
 		 294 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  47.46 
 
 		 294 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 294 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 294 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 282 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  47.46 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  47.75 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 282 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  49.48 
 
 		 284 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 		 284 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  48.59 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  46.78 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  49.48 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  46.78 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 		 288 aa  262  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  48.43 
 
 		 286 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  48.43 
 
 		 286 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  47.74 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  48.81 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  48.08 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  50.17 
 
 		 287 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  48.24 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  51.24 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  48.07 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  48.64 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  47.4 
 
 		 281 aa  259  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  48.61 
 
 		 287 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  47.1 
 
 		 287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  46.1 
 
 		 293 aa  258  8e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  47.54 
 
 		 283 aa  258  9e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  47.72 
 
 		 282 aa  258  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  46.48 
 
 		 284 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  47.57 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  47.42 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  48.08 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  46.6 
 
 		 286 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  46.94 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 280 aa  255  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  48.29 
 
 		 286 aa  255  8e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  46.71 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  45.89 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  47.92 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  44.14 
 
 		 284 aa  252  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  44.13 
 
 		 296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  44.56 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  45.61 
 
 		 288 aa  251  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  47.37 
 
 		 289 aa  252  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  47.62 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  47.62 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  47.62 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  47.62 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  46.67 
 
 		 288 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  47.62 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>