More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0643 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
284 aa  577  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  59.01 
 
 
282 aa  341  8e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  58.66 
 
 
283 aa  333  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  57.64 
 
 
287 aa  330  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  58.1 
 
 
282 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  58.1 
 
 
282 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 
282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  58.28 
 
 
289 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  57.75 
 
 
283 aa  325  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  56.29 
 
 
288 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 
282 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  57.8 
 
 
282 aa  323  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 
288 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  56.36 
 
 
294 aa  321  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  57.75 
 
 
285 aa  321  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 
288 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  57.65 
 
 
284 aa  320  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 
289 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 
281 aa  319  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  56.1 
 
 
288 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  56.4 
 
 
294 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  56.4 
 
 
294 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  57.75 
 
 
287 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 
286 aa  318  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  56.4 
 
 
294 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  56.4 
 
 
288 aa  318  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  54.74 
 
 
282 aa  318  7e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  56.61 
 
 
294 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  55.2 
 
 
286 aa  316  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  56.21 
 
 
295 aa  316  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0748  formyltetrahydrofolate deformylase  57.39 
 
 
291 aa  316  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.811069  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  55.93 
 
 
294 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  55.93 
 
 
294 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0690  formyltetrahydrofolate deformylase  56.99 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  56.1 
 
 
283 aa  314  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  59.57 
 
 
280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  55.67 
 
 
283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  55.16 
 
 
294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  56.34 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  55.75 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  56.74 
 
 
302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  55.28 
 
 
307 aa  312  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  55.28 
 
 
282 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 
303 aa  311  5.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  55.05 
 
 
284 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 
309 aa  311  6.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  54.7 
 
 
284 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  54.48 
 
 
294 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  54.48 
 
 
294 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  56.94 
 
 
285 aa  309  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  57.44 
 
 
285 aa  308  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
294 aa  308  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3462  formyltetrahydrofolate deformylase  56.03 
 
 
306 aa  308  8e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  59.64 
 
 
288 aa  308  9e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  56.55 
 
 
293 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  51.96 
 
 
294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  55.2 
 
 
294 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  53.6 
 
 
294 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 
284 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  55.02 
 
 
293 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  55.02 
 
 
293 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 
294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  55.02 
 
 
293 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  54.51 
 
 
294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  54.51 
 
 
294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  53.57 
 
 
294 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3546  formyltetrahydrofolate deformylase  55.89 
 
 
295 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299703  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  53.57 
 
 
294 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  52.16 
 
 
294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  56.01 
 
 
295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  52.52 
 
 
293 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  53.31 
 
 
282 aa  301  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  51.8 
 
 
294 aa  301  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 
303 aa  300  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 
293 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  52.52 
 
 
294 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
292 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
292 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8736  formyltetrahydrofolate deformylase  54.55 
 
 
294 aa  295  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.356392 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  51.39 
 
 
289 aa  294  9e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 
292 aa  293  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  51.94 
 
 
282 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03765  formyltetrahydrofolate deformylase  54.92 
 
 
263 aa  292  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2891  formyltetrahydrofolate deformylase  53.77 
 
 
283 aa  292  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2094  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
298 aa  291  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689957  normal  0.0344586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 
287 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  52.52 
 
 
290 aa  289  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  52.63 
 
 
288 aa  288  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  52.65 
 
 
297 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2111  formyltetrahydrofolate deformylase  54.12 
 
 
301 aa  285  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229424  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
287 aa  285  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
298 aa  284  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  52.26 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 
292 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
289 aa  281  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>