More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1352 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 282 aa  590  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  63.44 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  63.03 
 
 		 288 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  64.64 
 
 		 290 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  64.16 
 
 		 296 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  61.43 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  61.79 
 
 		 282 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  61.43 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  61.43 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  62.14 
 
 		 283 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  61.92 
 
 		 283 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  62.5 
 
 		 283 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  60.85 
 
 		 283 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  61.07 
 
 		 283 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  62.5 
 
 		 283 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  61.79 
 
 		 283 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  59.15 
 
 		 291 aa  363  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  60.57 
 
 		 287 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  58.3 
 
 		 284 aa  359  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  58.66 
 
 		 285 aa  358  4e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 		 289 aa  350  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 		 286 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  56.18 
 
 		 283 aa  332  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4965  formyltetrahydrofolate deformylase  54.77 
 
 		 289 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  53.43 
 
 		 284 aa  322  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  51.76 
 
 		 284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3654  formyltetrahydrofolate deformylase  52.82 
 
 		 290 aa  316  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 291 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  51.96 
 
 		 282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 		 288 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 		 316 aa  308  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 284 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  53.24 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  52.81 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 288 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 284 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 292 aa  298  7e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 284 aa  298  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 		 284 aa  298  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  52.52 
 
 		 300 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 296 aa  295  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  51.8 
 
 		 283 aa  294  9e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 283 aa  292  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  52.16 
 
 		 294 aa  292  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  52.16 
 
 		 294 aa  292  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 282 aa  291  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 282 aa  291  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 287 aa  291  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 282 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 		 299 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 282 aa  288  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 		 303 aa  288  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 284 aa  288  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 293 aa  288  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 286 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 286 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 286 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 287 aa  285  5.999999999999999e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 287 aa  285  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 294 aa  285  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  47.54 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  48.74 
 
 		 302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 286 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 		 288 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  47.59 
 
 		 295 aa  281  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 295 aa  282  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 		 294 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  45.26 
 
 		 292 aa  281  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  45.26 
 
 		 292 aa  281  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 284 aa  281  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 289 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 287 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  46.93 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 307 aa  279  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2094  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 298 aa  279  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689957  normal  0.0344586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  44.88 
 
 		 288 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0690  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 		 286 aa  279  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 		 288 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  44.91 
 
 		 292 aa  278  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 		 294 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 		 289 aa  278  9e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 285 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  47.16 
 
 		 284 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  47.35 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  45.74 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>