More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3470 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 288 aa  598  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  85.87 
 
 		 284 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  82.29 
 
 		 288 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  81.94 
 
 		 288 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  81.6 
 
 		 288 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  57.75 
 
 		 309 aa  344  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  56.94 
 
 		 290 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  57.3 
 
 		 284 aa  338  7e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  56.06 
 
 		 289 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 291 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 291 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 291 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 291 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 291 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 291 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  55.67 
 
 		 303 aa  334  9e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 291 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 291 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 284 aa  333  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  53.93 
 
 		 294 aa  328  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  55 
 
 		 294 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  55 
 
 		 294 aa  328  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  54.12 
 
 		 292 aa  328  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  54.12 
 
 		 292 aa  328  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 		 284 aa  328  9e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  56.07 
 
 		 282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  54.48 
 
 		 292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5073  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 291 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  54.06 
 
 		 287 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1106  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 		 290 aa  326  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0738057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  55.28 
 
 		 288 aa  325  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 		 290 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  56.31 
 
 		 294 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  53.93 
 
 		 294 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 		 288 aa  324  9e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 293 aa  323  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0585  formyltetrahydrofolate deformylase  53.26 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  55.33 
 
 		 289 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 		 292 aa  323  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  55.33 
 
 		 289 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  53.87 
 
 		 291 aa  322  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  55.14 
 
 		 294 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  55.28 
 
 		 288 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  56.84 
 
 		 287 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  53.76 
 
 		 294 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5211  formyltetrahydrofolate deformylase  53.26 
 
 		 294 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  55.56 
 
 		 282 aa  322  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3294  formyltetrahydrofolate deformylase  53.26 
 
 		 294 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5074  formyltetrahydrofolate deformylase  53.26 
 
 		 294 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  55.16 
 
 		 297 aa  321  8e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2111  formyltetrahydrofolate deformylase  55.28 
 
 		 301 aa  320  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 293 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  54.86 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  54.76 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  54.86 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  58.39 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4486  formyltetrahydrofolate deformylase  53.31 
 
 		 294 aa  319  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2891  formyltetrahydrofolate deformylase  55.67 
 
 		 283 aa  318  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  54.83 
 
 		 295 aa  318  7e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3462  formyltetrahydrofolate deformylase  55.02 
 
 		 306 aa  318  7.999999999999999e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5011  formyltetrahydrofolate deformylase  53.31 
 
 		 294 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  55.83 
 
 		 285 aa  318  9e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 		 294 aa  317  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3565  formyltetrahydrofolate deformylase  53.31 
 
 		 294 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1027  formyltetrahydrofolate deformylase  52.1 
 
 		 296 aa  317  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.423209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 294 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  54.74 
 
 		 287 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 		 281 aa  315  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 288 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 		 283 aa  315  4e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 		 282 aa  315  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  55.12 
 
 		 282 aa  314  9e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  52.31 
 
 		 294 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  52.31 
 
 		 294 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  57.3 
 
 		 285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  53.82 
 
 		 282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 		 284 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0456  formyltetrahydrofolate deformylase  51.22 
 
 		 285 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  57.45 
 
 		 284 aa  312  4.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  54.29 
 
 		 298 aa  311  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 294 aa  311  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  51.92 
 
 		 288 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  54.09 
 
 		 283 aa  310  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03765  formyltetrahydrofolate deformylase  56.6 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  53.82 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5203  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  53.71 
 
 		 302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  53.68 
 
 		 287 aa  309  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4717  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 285 aa  308  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>