More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2756 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
288 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  65.71 
 
 
292 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  64.24 
 
 
292 aa  397  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  65.71 
 
 
292 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0456  formyltetrahydrofolate deformylase  65.03 
 
 
285 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0350  formyltetrahydrofolate deformylase  65.73 
 
 
285 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231055  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0327  formyltetrahydrofolate deformylase  66.08 
 
 
285 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.212185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4717  formyltetrahydrofolate deformylase  64.69 
 
 
285 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5203  formyltetrahydrofolate deformylase  64.69 
 
 
285 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4880  formyltetrahydrofolate deformylase  66.08 
 
 
285 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0349  formyltetrahydrofolate deformylase  66.08 
 
 
285 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6208  formyltetrahydrofolate deformylase  63.99 
 
 
285 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1002  formyltetrahydrofolate deformylase  64.11 
 
 
288 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71530  formyltetrahydrofolate deformylase  63.99 
 
 
285 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4127  formyltetrahydrofolate deformylase  62.5 
 
 
287 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1027  formyltetrahydrofolate deformylase  62.86 
 
 
296 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.423209  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  51.92 
 
 
288 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  53.5 
 
 
290 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  51.93 
 
 
288 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0585  formyltetrahydrofolate deformylase  52.98 
 
 
294 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 
290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  51.23 
 
 
284 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  53.17 
 
 
291 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 
298 aa  301  8.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  48.97 
 
 
295 aa  301  9e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5211  formyltetrahydrofolate deformylase  52.82 
 
 
294 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63387  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3294  formyltetrahydrofolate deformylase  52.82 
 
 
294 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4486  formyltetrahydrofolate deformylase  51.56 
 
 
294 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5074  formyltetrahydrofolate deformylase  52.82 
 
 
294 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 
291 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 
291 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 
291 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5011  formyltetrahydrofolate deformylase  51.56 
 
 
294 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 
291 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 
291 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 
291 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 
291 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1106  formyltetrahydrofolate deformylase  52.28 
 
 
290 aa  298  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0738057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 
292 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  50.7 
 
 
289 aa  297  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3565  formyltetrahydrofolate deformylase  51.21 
 
 
294 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 
291 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
288 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5073  formyltetrahydrofolate deformylase  51.04 
 
 
291 aa  294  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 
287 aa  294  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
303 aa  294  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 
288 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
282 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
289 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
289 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 
282 aa  290  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 
282 aa  290  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 
284 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
283 aa  290  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 
287 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 
284 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 
285 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 
284 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 
297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  48.24 
 
 
284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  48.78 
 
 
294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  48.6 
 
 
285 aa  282  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.95 
 
 
285 aa  282  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
293 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 
283 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  48.78 
 
 
294 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 
294 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 
303 aa  280  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 
294 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  44.88 
 
 
282 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 
293 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  48.08 
 
 
294 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 
287 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 
294 aa  279  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 
294 aa  279  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 
282 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
287 aa  278  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  47.37 
 
 
309 aa  278  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
288 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 
288 aa  278  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  47.57 
 
 
289 aa  278  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  46.59 
 
 
294 aa  278  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  45.52 
 
 
294 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
293 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
293 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
293 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
288 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  45.68 
 
 
294 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 
295 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0748  formyltetrahydrofolate deformylase  46.34 
 
 
291 aa  276  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.811069  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 
291 aa  275  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  44.8 
 
 
294 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  42.66 
 
 
287 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 
281 aa  275  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.569737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>