More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1027 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1027  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 296 aa  620  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.423209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  73.43 
 
 		 292 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  71.68 
 
 		 292 aa  441  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  71.68 
 
 		 292 aa  441  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6208  formyltetrahydrofolate deformylase  62.11 
 
 		 285 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0456  formyltetrahydrofolate deformylase  62.24 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  62.86 
 
 		 288 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71530  formyltetrahydrofolate deformylase  62.11 
 
 		 285 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4717  formyltetrahydrofolate deformylase  61.05 
 
 		 285 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5203  formyltetrahydrofolate deformylase  61.19 
 
 		 285 aa  371  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0350  formyltetrahydrofolate deformylase  61.19 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231055  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0327  formyltetrahydrofolate deformylase  61.19 
 
 		 285 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.212185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0349  formyltetrahydrofolate deformylase  61.19 
 
 		 285 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4127  formyltetrahydrofolate deformylase  61.4 
 
 		 287 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4880  formyltetrahydrofolate deformylase  60.84 
 
 		 285 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1002  formyltetrahydrofolate deformylase  62.19 
 
 		 288 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  52.1 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  52.8 
 
 		 282 aa  316  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  53 
 
 		 290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 288 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 		 284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 284 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 		 288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  53.93 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5073  formyltetrahydrofolate deformylase  51.24 
 
 		 291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837668 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 		 291 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1106  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 		 290 aa  301  9e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0738057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  52.67 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  53.15 
 
 		 294 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 288 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 292 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 290 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0585  formyltetrahydrofolate deformylase  50.34 
 
 		 294 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  52.1 
 
 		 294 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 288 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 303 aa  295  9e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3565  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  52.1 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  52.1 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5011  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 294 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  51.75 
 
 		 294 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 		 285 aa  292  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 288 aa  291  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 289 aa  292  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5211  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3294  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5074  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  51.93 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  52.45 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  52.45 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 298 aa  289  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4486  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 294 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 303 aa  288  7e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  48.44 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  49.47 
 
 		 289 aa  286  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  51.58 
 
 		 293 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  51.58 
 
 		 293 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  51.58 
 
 		 293 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 		 282 aa  285  7e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 		 295 aa  285  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  51.23 
 
 		 293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  51.23 
 
 		 293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  51.23 
 
 		 293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  51.23 
 
 		 293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 283 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  48.1 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  45.88 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 285 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 287 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  48.77 
 
 		 284 aa  278  6e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 		 287 aa  278  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>