More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0350 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0350  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 285 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231055  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0327  formyltetrahydrofolate deformylase  98.6 
 
 		 285 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.212185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0349  formyltetrahydrofolate deformylase  98.6 
 
 		 285 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4880  formyltetrahydrofolate deformylase  96.84 
 
 		 285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5203  formyltetrahydrofolate deformylase  90.18 
 
 		 285 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0456  formyltetrahydrofolate deformylase  89.82 
 
 		 285 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4717  formyltetrahydrofolate deformylase  89.47 
 
 		 285 aa  530  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6208  formyltetrahydrofolate deformylase  87.02 
 
 		 285 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4127  formyltetrahydrofolate deformylase  86.32 
 
 		 287 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71530  formyltetrahydrofolate deformylase  87.37 
 
 		 285 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1002  formyltetrahydrofolate deformylase  70.28 
 
 		 288 aa  401  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  65.73 
 
 		 288 aa  394  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  62.63 
 
 		 292 aa  378  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1027  formyltetrahydrofolate deformylase  61.19 
 
 		 296 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.423209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  61.57 
 
 		 292 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  61.57 
 
 		 292 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  55.94 
 
 		 290 aa  318  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1106  formyltetrahydrofolate deformylase  56.45 
 
 		 290 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0738057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 		 291 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  55.94 
 
 		 290 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 		 291 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 		 291 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 		 291 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 		 291 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 		 291 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 		 291 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 		 291 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5073  formyltetrahydrofolate deformylase  54.55 
 
 		 291 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  52.61 
 
 		 288 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  55.09 
 
 		 291 aa  308  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0585  formyltetrahydrofolate deformylase  55.05 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5011  formyltetrahydrofolate deformylase  54.36 
 
 		 294 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3565  formyltetrahydrofolate deformylase  55.4 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  51.22 
 
 		 288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  50.17 
 
 		 288 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  52.52 
 
 		 282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  53 
 
 		 289 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  54.32 
 
 		 303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  52.65 
 
 		 292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5211  formyltetrahydrofolate deformylase  54.7 
 
 		 294 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3294  formyltetrahydrofolate deformylase  54.7 
 
 		 294 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5074  formyltetrahydrofolate deformylase  54.7 
 
 		 294 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4486  formyltetrahydrofolate deformylase  54.01 
 
 		 294 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  53.57 
 
 		 284 aa  301  9e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  51.22 
 
 		 288 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 287 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  53.5 
 
 		 298 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  51.44 
 
 		 294 aa  299  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  51.44 
 
 		 294 aa  299  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  52.3 
 
 		 289 aa  298  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  51.56 
 
 		 294 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 287 aa  292  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 		 282 aa  291  7e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 288 aa  290  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  50.69 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2891  formyltetrahydrofolate deformylase  51.24 
 
 		 283 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 284 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 284 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  50.69 
 
 		 294 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  50.69 
 
 		 294 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 		 293 aa  285  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 294 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  51.03 
 
 		 293 aa  284  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  48.44 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 		 288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  46.59 
 
 		 294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 		 294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 294 aa  280  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 		 284 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 		 294 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 297 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 294 aa  280  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  45.88 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 283 aa  279  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  48.08 
 
 		 289 aa  279  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  48.74 
 
 		 282 aa  279  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 283 aa  278  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  46.21 
 
 		 294 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 285 aa  278  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 285 aa  278  8e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 288 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 288 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 		 294 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 285 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 		 294 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 282 aa  275  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 		 284 aa  275  7e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  48.97 
 
 		 293 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 282 aa  275  9e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>