More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4036 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 292 aa  610  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 292 aa  610  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  87.33 
 
 		 292 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1027  formyltetrahydrofolate deformylase  71.68 
 
 		 296 aa  441  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.423209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  65.71 
 
 		 288 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0456  formyltetrahydrofolate deformylase  64.41 
 
 		 285 aa  384  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4717  formyltetrahydrofolate deformylase  64.41 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1002  formyltetrahydrofolate deformylase  65.37 
 
 		 288 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6208  formyltetrahydrofolate deformylase  62.99 
 
 		 285 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71530  formyltetrahydrofolate deformylase  62.99 
 
 		 285 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5203  formyltetrahydrofolate deformylase  62.63 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0327  formyltetrahydrofolate deformylase  61.57 
 
 		 285 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.212185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0349  formyltetrahydrofolate deformylase  61.57 
 
 		 285 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4127  formyltetrahydrofolate deformylase  62.41 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0350  formyltetrahydrofolate deformylase  61.57 
 
 		 285 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231055  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4880  formyltetrahydrofolate deformylase  60.85 
 
 		 285 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  54.12 
 
 		 288 aa  328  7e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  56.07 
 
 		 287 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  53.15 
 
 		 282 aa  325  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  53.31 
 
 		 288 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  54.96 
 
 		 289 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 284 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  54.42 
 
 		 290 aa  319  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 289 aa  319  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  52.4 
 
 		 294 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  52.38 
 
 		 294 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  52.4 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  53.5 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  53.5 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  52.4 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 		 290 aa  315  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  53.5 
 
 		 294 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 		 288 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 		 282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 		 288 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1106  formyltetrahydrofolate deformylase  53 
 
 		 290 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0738057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  51.93 
 
 		 298 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 		 291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  52.63 
 
 		 293 aa  308  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  52.11 
 
 		 282 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5073  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 		 291 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  52.11 
 
 		 282 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 		 288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 		 303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 284 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  51.89 
 
 		 293 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  51.89 
 
 		 293 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  51.89 
 
 		 293 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 		 292 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 288 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  51.4 
 
 		 288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  51.55 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  51.55 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  51.76 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  51.55 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  51.55 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 		 282 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 288 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  51.4 
 
 		 289 aa  301  9e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 		 309 aa  299  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0585  formyltetrahydrofolate deformylase  51.58 
 
 		 294 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5011  formyltetrahydrofolate deformylase  51.41 
 
 		 294 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 284 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3565  formyltetrahydrofolate deformylase  51.23 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  51.4 
 
 		 287 aa  297  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  53.41 
 
 		 285 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 294 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 284 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 288 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5211  formyltetrahydrofolate deformylase  51.41 
 
 		 294 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 		 307 aa  295  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3294  formyltetrahydrofolate deformylase  51.41 
 
 		 294 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5074  formyltetrahydrofolate deformylase  51.41 
 
 		 294 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4486  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 		 294 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  52.28 
 
 		 284 aa  295  7e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 282 aa  295  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 		 293 aa  295  8e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  51.76 
 
 		 283 aa  295  8e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 284 aa  291  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  47.62 
 
 		 295 aa  290  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2891  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 283 aa  289  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 285 aa  289  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>