More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0607 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
293 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  99.66 
 
 
293 aa  597  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  99.66 
 
 
293 aa  597  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
293 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  99.66 
 
 
293 aa  597  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
293 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  99.66 
 
 
293 aa  597  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  89.8 
 
 
294 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  88.44 
 
 
294 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  88.44 
 
 
294 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  88.44 
 
 
294 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  88.44 
 
 
294 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  96.25 
 
 
293 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  87.41 
 
 
294 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  87.41 
 
 
294 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  86.01 
 
 
289 aa  517  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  86.35 
 
 
289 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  85.32 
 
 
287 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  74.65 
 
 
288 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  72.16 
 
 
288 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  73.26 
 
 
288 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  73.87 
 
 
288 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  73.87 
 
 
288 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  66.9 
 
 
282 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  65.4 
 
 
282 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  66.78 
 
 
295 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  65.4 
 
 
282 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  64.83 
 
 
282 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  65.62 
 
 
285 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  64.11 
 
 
282 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  62.33 
 
 
289 aa  369  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  62.85 
 
 
282 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3546  formyltetrahydrofolate deformylase  64.26 
 
 
295 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299703  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  61.19 
 
 
283 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  61.89 
 
 
283 aa  364  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  62.63 
 
 
307 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  63.41 
 
 
282 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  61.81 
 
 
282 aa  364  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  63.54 
 
 
287 aa  362  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  60.84 
 
 
282 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  63.67 
 
 
282 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  61.32 
 
 
284 aa  358  8e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  59.58 
 
 
281 aa  357  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  58.48 
 
 
283 aa  350  1e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  60.14 
 
 
303 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  57.53 
 
 
298 aa  348  5e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  56.9 
 
 
295 aa  348  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  58.13 
 
 
283 aa  348  7e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  60.07 
 
 
284 aa  348  8e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8736  formyltetrahydrofolate deformylase  60.14 
 
 
294 aa  346  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  61.54 
 
 
285 aa  345  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  61.46 
 
 
297 aa  345  7e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  59.25 
 
 
284 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03765  formyltetrahydrofolate deformylase  63.47 
 
 
263 aa  344  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  56.29 
 
 
294 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  61.51 
 
 
285 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  57.09 
 
 
284 aa  335  5.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  57.34 
 
 
303 aa  335  5.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  55.24 
 
 
294 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  55.24 
 
 
294 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  56.9 
 
 
286 aa  333  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  53.82 
 
 
294 aa  329  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  52.8 
 
 
293 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  57.64 
 
 
286 aa  329  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0690  formyltetrahydrofolate deformylase  55.48 
 
 
286 aa  328  7e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  55.24 
 
 
294 aa  328  7e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  55.24 
 
 
294 aa  328  7e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  57.79 
 
 
291 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  57.79 
 
 
291 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  57.79 
 
 
291 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  52.08 
 
 
294 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  57.79 
 
 
291 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  57.79 
 
 
291 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  57.79 
 
 
291 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  51.74 
 
 
294 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  57.79 
 
 
291 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  56.36 
 
 
287 aa  324  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  55.21 
 
 
309 aa  322  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  56.55 
 
 
284 aa  322  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  53.61 
 
 
292 aa  321  7e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  56.79 
 
 
302 aa  322  7e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  51.39 
 
 
294 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  56.1 
 
 
284 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  51.9 
 
 
294 aa  321  9.000000000000001e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  55.44 
 
 
290 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 
282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  56.4 
 
 
291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  53.26 
 
 
292 aa  319  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  53.26 
 
 
292 aa  319  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  50.17 
 
 
294 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  56.45 
 
 
288 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  54.3 
 
 
288 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  55.24 
 
 
293 aa  318  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 
287 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  56.25 
 
 
292 aa  318  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  52.22 
 
 
289 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  55.56 
 
 
290 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  56.1 
 
 
288 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 
288 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3462  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 
306 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>