More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2106 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 288 aa  597  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  81.94 
 
 		 288 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  80.21 
 
 		 288 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  78.82 
 
 		 288 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  80.21 
 
 		 284 aa  478  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  60.21 
 
 		 284 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  59.01 
 
 		 309 aa  338  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  56.43 
 
 		 294 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  56.84 
 
 		 291 aa  334  9e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  58.16 
 
 		 290 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  57.5 
 
 		 294 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  57.5 
 
 		 294 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5073  formyltetrahydrofolate deformylase  56.14 
 
 		 291 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  56.1 
 
 		 290 aa  331  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  56.79 
 
 		 294 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  56.58 
 
 		 284 aa  330  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  56.07 
 
 		 294 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  55.82 
 
 		 292 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  55.91 
 
 		 294 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1106  formyltetrahydrofolate deformylase  57.09 
 
 		 290 aa  328  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0738057 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  56.07 
 
 		 293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  55 
 
 		 294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  55 
 
 		 294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2891  formyltetrahydrofolate deformylase  57.39 
 
 		 283 aa  326  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0585  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 		 294 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 		 284 aa  325  7e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  53.31 
 
 		 292 aa  324  8.000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  53.31 
 
 		 292 aa  324  8.000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 289 aa  324  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 		 288 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  51.92 
 
 		 292 aa  323  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  59.22 
 
 		 282 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 		 282 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 		 288 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  56.34 
 
 		 288 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  57.65 
 
 		 294 aa  322  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4486  formyltetrahydrofolate deformylase  55.48 
 
 		 294 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5011  formyltetrahydrofolate deformylase  55.48 
 
 		 294 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5211  formyltetrahydrofolate deformylase  55.48 
 
 		 294 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3294  formyltetrahydrofolate deformylase  55.48 
 
 		 294 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5074  formyltetrahydrofolate deformylase  55.48 
 
 		 294 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3565  formyltetrahydrofolate deformylase  55.29 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2111  formyltetrahydrofolate deformylase  57.39 
 
 		 301 aa  319  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 		 288 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 		 288 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5203  formyltetrahydrofolate deformylase  53.66 
 
 		 285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4717  formyltetrahydrofolate deformylase  53.31 
 
 		 285 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  55.67 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  57.65 
 
 		 282 aa  317  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  56.58 
 
 		 282 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  54.29 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  55.86 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0456  formyltetrahydrofolate deformylase  52.96 
 
 		 285 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  56.23 
 
 		 282 aa  315  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  55.79 
 
 		 287 aa  315  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  56.6 
 
 		 287 aa  315  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3462  formyltetrahydrofolate deformylase  55.75 
 
 		 306 aa  315  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 		 302 aa  315  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  56.89 
 
 		 285 aa  315  7e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  56.58 
 
 		 294 aa  315  8e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  56.58 
 
 		 294 aa  315  8e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  55.05 
 
 		 287 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  55.67 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1027  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 296 aa  312  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.423209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  55.79 
 
 		 282 aa  312  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 		 282 aa  311  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  58.56 
 
 		 291 aa  311  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  53.93 
 
 		 294 aa  311  9e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  55.17 
 
 		 289 aa  310  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0350  formyltetrahydrofolate deformylase  52.61 
 
 		 285 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231055  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 		 298 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  55.16 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2094  formyltetrahydrofolate deformylase  51.75 
 
 		 298 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689957  normal  0.0344586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  55.17 
 
 		 289 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  55.16 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8736  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 294 aa  309  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4127  formyltetrahydrofolate deformylase  54.51 
 
 		 287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 		 281 aa  309  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 		 282 aa  308  5e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  55.67 
 
 		 282 aa  308  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  54.9 
 
 		 298 aa  308  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  55.28 
 
 		 283 aa  308  8e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  56.23 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  52.9 
 
 		 294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  52.56 
 
 		 294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  55.59 
 
 		 285 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 		 293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  52.56 
 
 		 294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  52.56 
 
 		 294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>