More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2211 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 288 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  92.71 
 
 		 288 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  82.29 
 
 		 288 aa  510  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  82.64 
 
 		 288 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  81.6 
 
 		 288 aa  508  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  73.17 
 
 		 289 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  71.43 
 
 		 289 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  73.24 
 
 		 287 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  71.23 
 
 		 294 aa  434  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  70.55 
 
 		 294 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  70.21 
 
 		 294 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  70.55 
 
 		 294 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  70.55 
 
 		 294 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  70.21 
 
 		 294 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  70.21 
 
 		 294 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  69.76 
 
 		 293 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  69.76 
 
 		 293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  69.76 
 
 		 293 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  69.76 
 
 		 293 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  69.76 
 
 		 293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  69.76 
 
 		 293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  69.76 
 
 		 293 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  69.76 
 
 		 293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  64.34 
 
 		 282 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  65.37 
 
 		 282 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  64.85 
 
 		 295 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  64.89 
 
 		 283 aa  378  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  63.73 
 
 		 282 aa  378  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  63.73 
 
 		 282 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  64.79 
 
 		 282 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  60.14 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  64.81 
 
 		 282 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  63.64 
 
 		 282 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3546  formyltetrahydrofolate deformylase  65.62 
 
 		 295 aa  371  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  61.35 
 
 		 282 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8736  formyltetrahydrofolate deformylase  64.18 
 
 		 294 aa  367  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  64.93 
 
 		 285 aa  368  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  64.79 
 
 		 307 aa  367  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  62.28 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  60.27 
 
 		 295 aa  363  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  62.37 
 
 		 285 aa  362  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  60.76 
 
 		 285 aa  361  8e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  60.78 
 
 		 282 aa  360  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  58.87 
 
 		 298 aa  358  4e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  60.84 
 
 		 284 aa  358  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  58.8 
 
 		 284 aa  358  8e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  59.36 
 
 		 284 aa  354  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  58.51 
 
 		 283 aa  353  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  57.8 
 
 		 303 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  58.04 
 
 		 286 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  59.65 
 
 		 284 aa  349  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  60.92 
 
 		 282 aa  346  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  58.39 
 
 		 286 aa  345  6e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  57.6 
 
 		 281 aa  341  8e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03765  formyltetrahydrofolate deformylase  62.55 
 
 		 263 aa  341  9e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  57.95 
 
 		 283 aa  340  2e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  57.95 
 
 		 283 aa  340  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 		 282 aa  338  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2891  formyltetrahydrofolate deformylase  56.89 
 
 		 283 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  56.18 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 		 294 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  57.09 
 
 		 303 aa  332  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  54.26 
 
 		 293 aa  332  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 		 302 aa  332  6e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  56.1 
 
 		 282 aa  331  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 294 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 294 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  56.99 
 
 		 288 aa  329  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0690  formyltetrahydrofolate deformylase  56.18 
 
 		 286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  57.19 
 
 		 297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  56.03 
 
 		 294 aa  326  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  56.03 
 
 		 294 aa  326  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 294 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  53.52 
 
 		 294 aa  325  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  56.34 
 
 		 290 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 		 288 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 		 288 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 		 284 aa  322  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  56.38 
 
 		 293 aa  322  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 		 294 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 		 294 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0748  formyltetrahydrofolate deformylase  53.66 
 
 		 291 aa  321  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.811069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  53.17 
 
 		 294 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  56.4 
 
 		 284 aa  318  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  55.4 
 
 		 290 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  54.42 
 
 		 294 aa  317  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  56.34 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  56.14 
 
 		 291 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 		 287 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  54.42 
 
 		 294 aa  317  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  56.99 
 
 		 280 aa  317  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 288 aa  316  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>