More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1106 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1106  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 290 aa  594  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0738057 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  91.38 
 
 		 290 aa  547  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  89.66 
 
 		 290 aa  537  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  86.25 
 
 		 291 aa  511  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  84.54 
 
 		 291 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  84.54 
 
 		 291 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  84.54 
 
 		 291 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  84.54 
 
 		 291 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  84.54 
 
 		 291 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  84.54 
 
 		 291 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  84.54 
 
 		 291 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3565  formyltetrahydrofolate deformylase  82.99 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5011  formyltetrahydrofolate deformylase  82.99 
 
 		 294 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0585  formyltetrahydrofolate deformylase  83.33 
 
 		 294 aa  494  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5211  formyltetrahydrofolate deformylase  82.99 
 
 		 294 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3294  formyltetrahydrofolate deformylase  82.99 
 
 		 294 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4486  formyltetrahydrofolate deformylase  82.65 
 
 		 294 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5074  formyltetrahydrofolate deformylase  82.99 
 
 		 294 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  78.42 
 
 		 292 aa  474  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5073  formyltetrahydrofolate deformylase  78.35 
 
 		 291 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837668 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  78.69 
 
 		 291 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  57.09 
 
 		 288 aa  328  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 		 288 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 		 288 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 		 288 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0456  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 		 285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  58.19 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  54.42 
 
 		 292 aa  319  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 		 284 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0350  formyltetrahydrofolate deformylase  56.45 
 
 		 285 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231055  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1002  formyltetrahydrofolate deformylase  57.39 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  57.89 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  57.19 
 
 		 288 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5203  formyltetrahydrofolate deformylase  56.45 
 
 		 285 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  55.4 
 
 		 288 aa  314  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  55.44 
 
 		 294 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4717  formyltetrahydrofolate deformylase  56.45 
 
 		 285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  56.94 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  55.56 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4880  formyltetrahydrofolate deformylase  56.25 
 
 		 285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0327  formyltetrahydrofolate deformylase  56.1 
 
 		 285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.212185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0349  formyltetrahydrofolate deformylase  56.1 
 
 		 285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 		 289 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  53 
 
 		 292 aa  311  7.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  53 
 
 		 292 aa  311  7.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  55.17 
 
 		 289 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  56.21 
 
 		 294 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  54.77 
 
 		 282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4127  formyltetrahydrofolate deformylase  55.56 
 
 		 287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 		 294 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  55.94 
 
 		 287 aa  308  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 		 294 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 		 294 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71530  formyltetrahydrofolate deformylase  55.75 
 
 		 285 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6208  formyltetrahydrofolate deformylase  55.4 
 
 		 285 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  54.92 
 
 		 294 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  54.92 
 
 		 294 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  54.17 
 
 		 289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  53.55 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  52.98 
 
 		 289 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  53.98 
 
 		 303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1027  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 		 296 aa  301  9e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.423209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  52.94 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  52.28 
 
 		 288 aa  298  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  51.6 
 
 		 294 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  53.71 
 
 		 283 aa  298  7e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 		 293 aa  298  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 293 aa  298  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  53.71 
 
 		 283 aa  298  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 294 aa  298  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 294 aa  298  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  53.12 
 
 		 284 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  52.31 
 
 		 294 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 		 283 aa  296  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  52.46 
 
 		 284 aa  294  9e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  54.86 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  54.86 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  54.86 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 298 aa  292  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 309 aa  291  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  54.51 
 
 		 293 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  52.3 
 
 		 284 aa  291  7e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  54.51 
 
 		 293 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  54.51 
 
 		 293 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  54.51 
 
 		 293 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 294 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  53.52 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  53.5 
 
 		 285 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 		 282 aa  289  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 298 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 293 aa  288  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 294 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  54.2 
 
 		 291 aa  288  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 294 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 		 285 aa  288  9e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2891  formyltetrahydrofolate deformylase  54.09 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  52.28 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>