More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0556 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  63.73 
 
 		 303 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  61.25 
 
 		 294 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  60.78 
 
 		 287 aa  348  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  60 
 
 		 294 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  60 
 
 		 294 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  59.66 
 
 		 294 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  59.66 
 
 		 294 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  61.4 
 
 		 284 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  60.35 
 
 		 289 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  56.89 
 
 		 290 aa  339  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  60.21 
 
 		 294 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  60.21 
 
 		 294 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  60.35 
 
 		 289 aa  338  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  58.87 
 
 		 284 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  59.72 
 
 		 293 aa  332  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  59.38 
 
 		 293 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  59.38 
 
 		 293 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  59.38 
 
 		 293 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  59.38 
 
 		 293 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  59.38 
 
 		 293 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  59.38 
 
 		 293 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  59.38 
 
 		 293 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  57.19 
 
 		 288 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  56.43 
 
 		 284 aa  324  9e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  58.25 
 
 		 288 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  57.54 
 
 		 288 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 		 283 aa  324  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  58.16 
 
 		 282 aa  322  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  55.16 
 
 		 288 aa  322  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  56.58 
 
 		 293 aa  321  9.000000000000001e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  54.3 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  58.25 
 
 		 287 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  57.69 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  54.51 
 
 		 289 aa  320  3e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 		 298 aa  320  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  55.67 
 
 		 291 aa  318  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 		 291 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 		 291 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 		 291 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 		 291 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 		 291 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 		 291 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 		 291 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 		 285 aa  316  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5073  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 291 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  57.09 
 
 		 282 aa  315  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  55.79 
 
 		 288 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  54.98 
 
 		 292 aa  315  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 		 291 aa  315  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  57.6 
 
 		 282 aa  315  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  56.63 
 
 		 282 aa  315  8e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  56.79 
 
 		 283 aa  314  9e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  53.76 
 
 		 292 aa  313  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  56.23 
 
 		 282 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 		 289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  54.04 
 
 		 287 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  56.63 
 
 		 284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  54.2 
 
 		 290 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  56.38 
 
 		 282 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  53.93 
 
 		 296 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 		 289 aa  311  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  56.38 
 
 		 282 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 		 283 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 288 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 		 283 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  56.54 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  56.43 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  53.24 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  56.16 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  55 
 
 		 287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  56.38 
 
 		 282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  56.55 
 
 		 285 aa  309  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 287 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 		 293 aa  308  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  54.06 
 
 		 290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  55 
 
 		 282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  52.88 
 
 		 288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 294 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  51.22 
 
 		 287 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 291 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 		 282 aa  305  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 		 282 aa  305  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  52.82 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1027  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.423209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1106  formyltetrahydrofolate deformylase  54.06 
 
 		 290 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0738057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  53.17 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 		 283 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 		 283 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  52.65 
 
 		 281 aa  302  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  53.76 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 		 283 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 294 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>