More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4812 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
290 aa  597  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1106  formyltetrahydrofolate deformylase  89.66 
 
 
290 aa  537  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0738057 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  87.59 
 
 
290 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  87.29 
 
 
291 aa  519  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  85.57 
 
 
291 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  85.57 
 
 
291 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  85.57 
 
 
291 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  85.57 
 
 
291 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  85.57 
 
 
291 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  85.57 
 
 
291 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  85.57 
 
 
291 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3565  formyltetrahydrofolate deformylase  84.01 
 
 
294 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5011  formyltetrahydrofolate deformylase  84.35 
 
 
294 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0585  formyltetrahydrofolate deformylase  83.67 
 
 
294 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3294  formyltetrahydrofolate deformylase  84.01 
 
 
294 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4486  formyltetrahydrofolate deformylase  84.01 
 
 
294 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5074  formyltetrahydrofolate deformylase  84.01 
 
 
294 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5211  formyltetrahydrofolate deformylase  84.01 
 
 
294 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63387  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5073  formyltetrahydrofolate deformylase  78.01 
 
 
291 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837668 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  77.82 
 
 
292 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  78.35 
 
 
291 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  56.1 
 
 
288 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  55.9 
 
 
287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  56.99 
 
 
289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 
288 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
288 aa  325  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  56.64 
 
 
289 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  56.34 
 
 
288 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  54.17 
 
 
292 aa  323  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 
288 aa  320  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0456  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 
285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  54.09 
 
 
288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 
294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 
284 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 
303 aa  318  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  54.42 
 
 
294 aa  318  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4127  formyltetrahydrofolate deformylase  56.64 
 
 
287 aa  317  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  54.08 
 
 
294 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  54.08 
 
 
294 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  56.34 
 
 
288 aa  316  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0350  formyltetrahydrofolate deformylase  55.94 
 
 
285 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231055  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 
288 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  56.43 
 
 
282 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0327  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 
285 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.212185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5203  formyltetrahydrofolate deformylase  56.14 
 
 
285 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0349  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 
285 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 
292 aa  315  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 
292 aa  315  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  56.99 
 
 
288 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4880  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 
285 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
294 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4717  formyltetrahydrofolate deformylase  56.18 
 
 
285 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  54.26 
 
 
289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  54.06 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  54.48 
 
 
294 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1002  formyltetrahydrofolate deformylase  56.94 
 
 
288 aa  310  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  54.48 
 
 
294 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  53.95 
 
 
295 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6208  formyltetrahydrofolate deformylase  55.44 
 
 
285 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71530  formyltetrahydrofolate deformylase  55.44 
 
 
285 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  53.47 
 
 
289 aa  308  5e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  55.48 
 
 
287 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 
293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 
284 aa  305  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 
283 aa  304  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 
288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  54.83 
 
 
293 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  54.04 
 
 
283 aa  301  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
293 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
293 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 
294 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 
294 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
293 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 
294 aa  298  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  51.96 
 
 
294 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  53.4 
 
 
293 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  53.4 
 
 
293 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  53.4 
 
 
293 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  53.4 
 
 
293 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1027  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
296 aa  297  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.423209  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  52.8 
 
 
298 aa  296  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  53.66 
 
 
291 aa  296  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  56.54 
 
 
285 aa  296  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 
283 aa  296  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
294 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
294 aa  295  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  56.43 
 
 
283 aa  294  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
294 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  51.76 
 
 
284 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 
294 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  53.68 
 
 
282 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  52.98 
 
 
287 aa  292  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2891  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 
283 aa  292  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  52.31 
 
 
284 aa  292  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  52.46 
 
 
284 aa  291  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
294 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 
294 aa  291  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 
294 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 
293 aa  290  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 
309 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>