More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5073 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5073  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837668 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  96.91 
 
 		 291 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  84.54 
 
 		 291 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  83.85 
 
 		 291 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  83.85 
 
 		 291 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  83.85 
 
 		 291 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  83.85 
 
 		 291 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  83.85 
 
 		 291 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  83.85 
 
 		 291 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  83.85 
 
 		 291 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  79.79 
 
 		 292 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  78.35 
 
 		 290 aa  475  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3565  formyltetrahydrofolate deformylase  79.32 
 
 		 294 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0585  formyltetrahydrofolate deformylase  79.32 
 
 		 294 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5211  formyltetrahydrofolate deformylase  78.64 
 
 		 294 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1106  formyltetrahydrofolate deformylase  78.35 
 
 		 290 aa  472  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0738057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3294  formyltetrahydrofolate deformylase  78.64 
 
 		 294 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5011  formyltetrahydrofolate deformylase  78.64 
 
 		 294 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5074  formyltetrahydrofolate deformylase  78.64 
 
 		 294 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4486  formyltetrahydrofolate deformylase  78.31 
 
 		 294 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  78.01 
 
 		 290 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  56.14 
 
 		 288 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 288 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  54.93 
 
 		 288 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 288 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0456  formyltetrahydrofolate deformylase  55.94 
 
 		 285 aa  318  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 297 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  53.17 
 
 		 284 aa  314  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4717  formyltetrahydrofolate deformylase  55.28 
 
 		 285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71530  formyltetrahydrofolate deformylase  55.44 
 
 		 285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4127  formyltetrahydrofolate deformylase  54.9 
 
 		 287 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5203  formyltetrahydrofolate deformylase  54.2 
 
 		 285 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6208  formyltetrahydrofolate deformylase  55.09 
 
 		 285 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0350  formyltetrahydrofolate deformylase  54.55 
 
 		 285 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231055  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 292 aa  308  5.9999999999999995e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 		 292 aa  308  6.999999999999999e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 		 292 aa  308  6.999999999999999e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0327  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 285 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.212185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0349  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 285 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 288 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 288 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 		 293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  53.79 
 
 		 294 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 298 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4880  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1027  formyltetrahydrofolate deformylase  51.24 
 
 		 296 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.423209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  52.98 
 
 		 288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  53.1 
 
 		 303 aa  301  7.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  52.41 
 
 		 294 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  52.19 
 
 		 294 aa  300  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  52.41 
 
 		 294 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  52.41 
 
 		 294 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  51.23 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  53.52 
 
 		 282 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  53.4 
 
 		 289 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 		 287 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  52.72 
 
 		 289 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  51.58 
 
 		 288 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  51.18 
 
 		 294 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 303 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  51.18 
 
 		 294 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 		 294 aa  294  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  51.74 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  51.04 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  52.8 
 
 		 284 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  54.06 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  51.72 
 
 		 295 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 282 aa  292  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 		 294 aa  291  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 283 aa  291  8e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  52.11 
 
 		 287 aa  290  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1002  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 284 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  51.69 
 
 		 293 aa  289  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 		 294 aa  289  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  52.1 
 
 		 283 aa  289  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 		 282 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 		 285 aa  288  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 294 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3462  formyltetrahydrofolate deformylase  52.58 
 
 		 306 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  52.31 
 
 		 290 aa  287  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  51.58 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  52.43 
 
 		 293 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 298 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  52.67 
 
 		 282 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  52.43 
 
 		 293 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  52.43 
 
 		 293 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 281 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 283 aa  285  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  54.04 
 
 		 302 aa  285  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>