More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0944 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 294 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  99.66 
 
 		 294 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  90.82 
 
 		 294 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  76.19 
 
 		 294 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  76.19 
 
 		 294 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  75.34 
 
 		 293 aa  474  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  75.17 
 
 		 294 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  73.47 
 
 		 294 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  76.19 
 
 		 294 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2094  formyltetrahydrofolate deformylase  74.32 
 
 		 298 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689957  normal  0.0344586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  73.04 
 
 		 298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  76.19 
 
 		 294 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  74.49 
 
 		 294 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  74.15 
 
 		 294 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  74.15 
 
 		 294 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  76.53 
 
 		 294 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  73.13 
 
 		 294 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  72.79 
 
 		 294 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  56.27 
 
 		 284 aa  341  8e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  60.07 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  56.89 
 
 		 284 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  55.56 
 
 		 282 aa  333  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  56.03 
 
 		 283 aa  332  4e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  57.5 
 
 		 288 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2111  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 		 301 aa  331  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 288 aa  330  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  55 
 
 		 288 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  55.91 
 
 		 281 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  55.12 
 
 		 284 aa  325  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  54.32 
 
 		 282 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 289 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  58.99 
 
 		 298 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  51.8 
 
 		 282 aa  322  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  54.36 
 
 		 294 aa  322  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 		 282 aa  322  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  55.4 
 
 		 282 aa  322  6e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  54.77 
 
 		 288 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  54.77 
 
 		 288 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0690  formyltetrahydrofolate deformylase  57.19 
 
 		 286 aa  321  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  54.01 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  54.77 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  55.04 
 
 		 282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 289 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  54.01 
 
 		 294 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  54.01 
 
 		 294 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  54.36 
 
 		 294 aa  318  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  53.45 
 
 		 295 aa  318  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  57.09 
 
 		 287 aa  318  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 		 288 aa  318  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  53.5 
 
 		 293 aa  316  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  53.15 
 
 		 293 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  53.15 
 
 		 293 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  53.15 
 
 		 293 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  56.83 
 
 		 303 aa  315  6e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1157  formyltetrahydrofolate deformylase  58.42 
 
 		 284 aa  315  8e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  55.04 
 
 		 283 aa  314  9e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 		 284 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 		 283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  54.26 
 
 		 287 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  52.8 
 
 		 293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  52.8 
 
 		 293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  52.8 
 
 		 293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  52.8 
 
 		 293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  52.96 
 
 		 294 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  52.96 
 
 		 294 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 282 aa  311  7.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 		 309 aa  311  9e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  56.12 
 
 		 302 aa  310  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  55.16 
 
 		 284 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  53.57 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  53.96 
 
 		 307 aa  309  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  54.48 
 
 		 284 aa  309  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 		 282 aa  309  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 288 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  56.03 
 
 		 285 aa  308  8e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  54.29 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 		 293 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  54.55 
 
 		 287 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 		 285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8736  formyltetrahydrofolate deformylase  53.17 
 
 		 294 aa  301  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  52.11 
 
 		 282 aa  301  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  55 
 
 		 285 aa  301  9e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  55.04 
 
 		 288 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  51.4 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  53.07 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 		 288 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 284 aa  296  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 		 280 aa  296  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  52.8 
 
 		 287 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  53.15 
 
 		 287 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 		 296 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  52.16 
 
 		 286 aa  295  7e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  53.24 
 
 		 282 aa  295  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  51.8 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>