More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0323 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 286 aa  590  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  79.09 
 
 		 287 aa  468  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  71.73 
 
 		 289 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  65.26 
 
 		 286 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  66.9 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  66.55 
 
 		 299 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  66.9 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  63.41 
 
 		 287 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  62.28 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  62.63 
 
 		 294 aa  361  8e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  62.19 
 
 		 296 aa  355  5.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  62.72 
 
 		 295 aa  352  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  59.15 
 
 		 300 aa  351  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  62.28 
 
 		 307 aa  351  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  59.72 
 
 		 299 aa  333  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  57.86 
 
 		 295 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  57.86 
 
 		 295 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 		 297 aa  326  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  57.75 
 
 		 287 aa  325  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  58.93 
 
 		 283 aa  324  8.000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  57.5 
 
 		 310 aa  322  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  59.43 
 
 		 291 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  55.48 
 
 		 296 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  54.55 
 
 		 284 aa  315  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  54.2 
 
 		 284 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  54.2 
 
 		 284 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  55.44 
 
 		 287 aa  311  7.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  55.59 
 
 		 288 aa  308  5e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  53.33 
 
 		 284 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  55.79 
 
 		 290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  55.56 
 
 		 289 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  55.67 
 
 		 282 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 284 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 		 288 aa  299  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  54.42 
 
 		 283 aa  298  8e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  53.41 
 
 		 288 aa  298  8e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  55.67 
 
 		 283 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  55.48 
 
 		 283 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  53.15 
 
 		 293 aa  297  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 		 284 aa  295  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  54.26 
 
 		 283 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  54.96 
 
 		 283 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  54.96 
 
 		 283 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 284 aa  291  7e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  54.96 
 
 		 283 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 		 283 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 		 283 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  54.01 
 
 		 287 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  54.12 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 282 aa  282  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 		 284 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  51.93 
 
 		 287 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  52.76 
 
 		 287 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  53.76 
 
 		 287 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 283 aa  276  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 316 aa  275  6e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 		 282 aa  275  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  52.33 
 
 		 297 aa  272  6e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 		 294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 		 289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  51.6 
 
 		 287 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  51.6 
 
 		 287 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  53.57 
 
 		 297 aa  269  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  49.48 
 
 		 284 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 		 294 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 288 aa  268  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 		 302 aa  267  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 		 285 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 		 285 aa  265  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  49.48 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  51.03 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 293 aa  261  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  46.67 
 
 		 284 aa  259  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 288 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 		 287 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 		 288 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 		 286 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>