More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4436 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
282 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  87.94 
 
 
283 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  87.94 
 
 
283 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  87.23 
 
 
283 aa  523  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  87.94 
 
 
283 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  87.94 
 
 
283 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  87.94 
 
 
283 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  84.75 
 
 
283 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  84.75 
 
 
283 aa  510  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  84.75 
 
 
283 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  82.98 
 
 
283 aa  501  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  72.5 
 
 
284 aa  441  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  72.86 
 
 
290 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  69.64 
 
 
288 aa  424  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  69.75 
 
 
285 aa  420  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  67.38 
 
 
283 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  67.26 
 
 
286 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  65.84 
 
 
287 aa  400  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  67.03 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  65.38 
 
 
291 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  63.83 
 
 
289 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  64.06 
 
 
287 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  61.79 
 
 
282 aa  378  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  61.57 
 
 
284 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  59.44 
 
 
291 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  60.21 
 
 
316 aa  360  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  57.95 
 
 
292 aa  354  6.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 
284 aa  341  9e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3654  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 
290 aa  338  5.9999999999999996e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4965  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 
289 aa  335  5e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  56.02 
 
 
267 aa  325  5e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 
283 aa  315  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 
297 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 
287 aa  302  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  55.67 
 
 
286 aa  301  8.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 
296 aa  299  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 
295 aa  298  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
303 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 
296 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
300 aa  292  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  51.62 
 
 
283 aa  291  6e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 
300 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 
287 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 
282 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 
287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
282 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 
289 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
282 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
282 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
289 aa  281  7.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
282 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 
284 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
287 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
287 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
299 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
282 aa  279  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  47.65 
 
 
284 aa  278  8e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 
284 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
286 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
287 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
294 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
294 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 
287 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 
284 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 
286 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 
286 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 
282 aa  275  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  48.2 
 
 
284 aa  275  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 
299 aa  275  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 
288 aa  275  6e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 
284 aa  275  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
294 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 
286 aa  272  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  48.01 
 
 
287 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  48.41 
 
 
289 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  46.69 
 
 
289 aa  271  7e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  48.26 
 
 
294 aa  271  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
280 aa  271  9e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 
283 aa  271  9e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 
281 aa  271  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 
288 aa  271  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 
284 aa  271  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 
288 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 
284 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 
284 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 
289 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 
287 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 
293 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 
288 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2891  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
283 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  48.41 
 
 
289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 
285 aa  269  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  46.62 
 
 
286 aa  269  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  47.57 
 
 
294 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>