More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 292 aa  593  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  76.66 
 
 		 291 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  71.13 
 
 		 316 aa  421  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3654  formyltetrahydrofolate deformylase  68.14 
 
 		 290 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  57.95 
 
 		 282 aa  354  7.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  58.3 
 
 		 283 aa  351  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4965  formyltetrahydrofolate deformylase  58.74 
 
 		 289 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  57.95 
 
 		 283 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  57.95 
 
 		 283 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  57.6 
 
 		 283 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 		 283 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  57.6 
 
 		 283 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  57.6 
 
 		 283 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 		 283 aa  345  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  55.29 
 
 		 287 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  56.54 
 
 		 283 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  56.54 
 
 		 283 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  58.87 
 
 		 288 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  58.04 
 
 		 290 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  56.84 
 
 		 289 aa  338  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  57.95 
 
 		 287 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 		 291 aa  335  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  53.87 
 
 		 284 aa  333  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  55.67 
 
 		 296 aa  325  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  51.76 
 
 		 283 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  53 
 
 		 285 aa  315  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  53.12 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 284 aa  300  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 286 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 282 aa  298  7e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 282 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  49.66 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  49.66 
 
 		 289 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  52 
 
 		 283 aa  275  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 		 282 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  48.61 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  47.95 
 
 		 295 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  49.81 
 
 		 267 aa  271  8.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  47.75 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  47.75 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  47.6 
 
 		 294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  49.15 
 
 		 285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 285 aa  268  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  47.6 
 
 		 294 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  47.28 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 		 284 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  46.92 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  47.4 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  47.4 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  51.41 
 
 		 282 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  51.41 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 286 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  48.59 
 
 		 281 aa  265  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 282 aa  265  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  47.16 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 284 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 		 293 aa  262  6e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  47.08 
 
 		 293 aa  261  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  48.59 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  47.18 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  45.65 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  45.36 
 
 		 288 aa  258  7e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  48.61 
 
 		 300 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  50.17 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  46.13 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  47.08 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  47.08 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  47.08 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  47.08 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  47.08 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  47.08 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  48.07 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  44.37 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  47.08 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 280 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  45.52 
 
 		 284 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  41.75 
 
 		 284 aa  255  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  45.36 
 
 		 287 aa  255  7e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0748  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 		 291 aa  255  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.811069  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  47.24 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 284 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>