More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2543 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
300 aa  616  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  88.33 
 
 
300 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  61.97 
 
 
287 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  62.54 
 
 
287 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  62.28 
 
 
286 aa  362  5.0000000000000005e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  61.57 
 
 
289 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  59.51 
 
 
299 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  59.43 
 
 
287 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  58.8 
 
 
286 aa  351  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  58.8 
 
 
286 aa  351  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  58.51 
 
 
286 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  58.72 
 
 
295 aa  340  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  59.07 
 
 
296 aa  335  7e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  54.84 
 
 
283 aa  328  8e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 
297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  54.42 
 
 
284 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  54.42 
 
 
284 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  55.56 
 
 
290 aa  318  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  51.71 
 
 
296 aa  318  9e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  53.12 
 
 
295 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  53.12 
 
 
295 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  56.43 
 
 
284 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  53.85 
 
 
299 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 
285 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 
284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 
287 aa  311  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  55.16 
 
 
294 aa  310  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  51.94 
 
 
287 aa  310  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 
310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  52.08 
 
 
288 aa  308  5e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  54.48 
 
 
288 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  52.88 
 
 
282 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  52.16 
 
 
288 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 
284 aa  305  7e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  53.24 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  54.01 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  54.48 
 
 
282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 
283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 
289 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 
284 aa  302  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
287 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  51.8 
 
 
284 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 
307 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
287 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  53.41 
 
 
283 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  54.68 
 
 
287 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  52.53 
 
 
291 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  52.16 
 
 
284 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  52.88 
 
 
284 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 
283 aa  298  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  52.65 
 
 
284 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 
291 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 
287 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
287 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  52.52 
 
 
303 aa  291  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 
293 aa  291  9e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 
283 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 
283 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 
282 aa  289  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 
284 aa  288  6e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
283 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
283 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
287 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
283 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
289 aa  288  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 
283 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 
286 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
292 aa  287  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
287 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
282 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
287 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
289 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
285 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
295 aa  285  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  52.54 
 
 
289 aa  285  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  51.24 
 
 
297 aa  285  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.29 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 
288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  51.08 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
282 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  46.85 
 
 
289 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
285 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 
291 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
285 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 
289 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 
281 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 
282 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  48.78 
 
 
295 aa  278  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
302 aa  277  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  48.2 
 
 
303 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>