More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2012 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
299 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  96.5 
 
 
286 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  96.5 
 
 
286 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  84.21 
 
 
286 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  68.33 
 
 
287 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  66.9 
 
 
289 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  66.55 
 
 
286 aa  378  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  62.86 
 
 
295 aa  353  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  59.51 
 
 
300 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  57.65 
 
 
294 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 
300 aa  347  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  56.79 
 
 
307 aa  344  1e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  57.71 
 
 
287 aa  342  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  57.29 
 
 
296 aa  338  8e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  57.5 
 
 
283 aa  332  6e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  56.83 
 
 
310 aa  323  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 
295 aa  322  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  56.83 
 
 
295 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  57.71 
 
 
297 aa  317  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  54.26 
 
 
287 aa  311  6.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  52.61 
 
 
284 aa  310  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  52.61 
 
 
284 aa  310  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 
296 aa  310  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  58.57 
 
 
299 aa  309  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  55.16 
 
 
289 aa  308  5.9999999999999995e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  55.91 
 
 
291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  54.08 
 
 
293 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  51.75 
 
 
287 aa  304  9.000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  52.61 
 
 
284 aa  304  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  54.26 
 
 
284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  52.96 
 
 
284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
288 aa  297  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 
288 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 
284 aa  295  9e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 
290 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
287 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  51.76 
 
 
287 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
288 aa  289  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 
287 aa  289  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 
282 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
285 aa  288  6e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 
292 aa  288  7e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 
309 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 
287 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 
284 aa  286  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
287 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
282 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  50.84 
 
 
296 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 
287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 
287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
289 aa  282  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
283 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 
283 aa  279  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  279  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
291 aa  279  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 
284 aa  278  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 
283 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 
283 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
287 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 
316 aa  277  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 
283 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
283 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
282 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
283 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
283 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  51.05 
 
 
285 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 
282 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
282 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
283 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  47.64 
 
 
307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 
285 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 
283 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
282 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 
284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  46.64 
 
 
282 aa  269  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
289 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
289 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
303 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  49.66 
 
 
291 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 
283 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
298 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 
294 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
291 aa  265  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
297 aa  265  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
285 aa  265  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 
294 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
303 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 
294 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 
294 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 
294 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 
284 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  46.1 
 
 
293 aa  262  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>