More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0467 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  71.73 
 
 
287 aa  431  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  69.44 
 
 
288 aa  427  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  66.67 
 
 
288 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  66.67 
 
 
292 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  64.87 
 
 
309 aa  378  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  53.57 
 
 
284 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  53.98 
 
 
289 aa  321  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  52.31 
 
 
296 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 
284 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  54.08 
 
 
299 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
284 aa  303  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  53.63 
 
 
286 aa  301  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  53.63 
 
 
286 aa  301  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  53.15 
 
 
296 aa  301  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 
287 aa  301  9e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  52.88 
 
 
283 aa  297  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  53.15 
 
 
286 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 
284 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 
284 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 
300 aa  291  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
286 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
287 aa  289  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
284 aa  288  8e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 
284 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 
290 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
288 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 
282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 
282 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 
285 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  278  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  278  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 
285 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
283 aa  277  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
287 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 
282 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 
282 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  47.08 
 
 
294 aa  276  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  51.41 
 
 
285 aa  276  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 
282 aa  272  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  45.1 
 
 
287 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
283 aa  271  7e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 
282 aa  270  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  45.23 
 
 
284 aa  270  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  48.25 
 
 
294 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
307 aa  269  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 
283 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 
283 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  45.85 
 
 
287 aa  269  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 
283 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 
294 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  51.08 
 
 
287 aa  268  8e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  47.77 
 
 
316 aa  267  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 
283 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 
297 aa  267  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 
307 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  45.74 
 
 
284 aa  267  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
289 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 
284 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 
295 aa  265  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 
289 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  45.77 
 
 
287 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 
284 aa  265  8e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  45.85 
 
 
282 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 
294 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 
294 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  46.15 
 
 
289 aa  263  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  46.59 
 
 
287 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 
285 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  46.5 
 
 
294 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 
284 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  46.1 
 
 
291 aa  263  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  45.32 
 
 
283 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 
294 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  47.16 
 
 
297 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 
294 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  45.07 
 
 
287 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 
289 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 
292 aa  262  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  46.13 
 
 
287 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  45.2 
 
 
294 aa  261  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  45.04 
 
 
290 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  46.9 
 
 
295 aa  261  8.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0690  formyltetrahydrofolate deformylase  48.2 
 
 
286 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 
280 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  45.04 
 
 
284 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  45.2 
 
 
294 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  46.5 
 
 
294 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 
283 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  45.74 
 
 
284 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 
283 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 
283 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
293 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 
283 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 
288 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  41.88 
 
 
284 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>