More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2122 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 297 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  61.62 
 
 		 287 aa  350  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 		 286 aa  326  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  56.18 
 
 		 287 aa  326  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  54.06 
 
 		 300 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  58.99 
 
 		 286 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  57.71 
 
 		 286 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  57.71 
 
 		 286 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  57.71 
 
 		 299 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 		 289 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  53.87 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  56.23 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  56.38 
 
 		 295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  56.03 
 
 		 295 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 294 aa  300  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  55.1 
 
 		 299 aa  298  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 295 aa  298  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  55 
 
 		 284 aa  295  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  56.54 
 
 		 291 aa  292  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  55.04 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  54.96 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  51.99 
 
 		 307 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  53.24 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  52.94 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 		 285 aa  279  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  52.52 
 
 		 283 aa  279  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  51.03 
 
 		 302 aa  278  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  51.96 
 
 		 289 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  50.17 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 281 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  47.54 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 287 aa  272  6e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  48.42 
 
 		 287 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 289 aa  272  6e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 284 aa  271  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0690  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 		 286 aa  271  8.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 		 282 aa  271  8.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 282 aa  271  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 		 289 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  55.04 
 
 		 285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 288 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 		 292 aa  269  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0748  formyltetrahydrofolate deformylase  51.8 
 
 		 291 aa  269  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.811069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  51.44 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 		 288 aa  268  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 284 aa  268  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 288 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  55.2 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  48.2 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 284 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 290 aa  265  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  51.8 
 
 		 280 aa  265  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 285 aa  265  8e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 309 aa  265  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 284 aa  265  8e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 282 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 288 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 		 283 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 284 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 284 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 285 aa  261  8e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.48 
 
 		 283 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  44.44 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 285 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  46.85 
 
 		 289 aa  259  4e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 		 283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 294 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>