More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1008 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 284 aa  580  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  75.7 
 
 		 284 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  75.62 
 
 		 284 aa  459  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  73.14 
 
 		 284 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  73.24 
 
 		 284 aa  447  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  73.24 
 
 		 284 aa  447  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  61.57 
 
 		 289 aa  354  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  59.22 
 
 		 284 aa  347  9e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  57.75 
 
 		 284 aa  339  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  59.21 
 
 		 296 aa  329  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  55.12 
 
 		 284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  58.1 
 
 		 284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  54.29 
 
 		 292 aa  326  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  55.28 
 
 		 284 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  54.93 
 
 		 284 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  58.01 
 
 		 295 aa  323  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  58.45 
 
 		 285 aa  322  4e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  54.42 
 
 		 284 aa  321  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  53.71 
 
 		 290 aa  318  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 		 284 aa  316  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  53.57 
 
 		 300 aa  315  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  56.32 
 
 		 283 aa  315  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  52.1 
 
 		 288 aa  313  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  53.07 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  54.61 
 
 		 296 aa  312  4.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 		 293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  56.03 
 
 		 285 aa  306  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 287 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  52.08 
 
 		 287 aa  301  7.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 284 aa  298  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  51.92 
 
 		 286 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  51.92 
 
 		 286 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 		 299 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  52.1 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  51.8 
 
 		 288 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 284 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 289 aa  280  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  52.26 
 
 		 307 aa  279  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 287 aa  279  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 284 aa  278  7e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 		 283 aa  278  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 		 294 aa  278  7e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  47.48 
 
 		 297 aa  278  8e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 		 284 aa  277  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  52.35 
 
 		 284 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 284 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 287 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 283 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 		 289 aa  275  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  48.38 
 
 		 285 aa  275  7e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 304 aa  275  7e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  51.62 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 		 283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 		 288 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  46.1 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 288 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  48.2 
 
 		 287 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  47.04 
 
 		 288 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 		 290 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 295 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 284 aa  265  7e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 295 aa  265  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  47.39 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 287 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  46.93 
 
 		 282 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  46.69 
 
 		 288 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  48.38 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  48.01 
 
 		 282 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  47.59 
 
 		 287 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 282 aa  258  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  47.29 
 
 		 282 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  48.74 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 289 aa  258  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 		 289 aa  258  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 309 aa  258  9e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>