More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12978 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 310 aa  632  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  80.99 
 
 		 295 aa  474  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  80.63 
 
 		 295 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  61.27 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  59.43 
 
 		 287 aa  345  7e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  58.16 
 
 		 295 aa  333  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  57.95 
 
 		 289 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  54.73 
 
 		 299 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  56.12 
 
 		 286 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  57.19 
 
 		 296 aa  321  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  56.12 
 
 		 286 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  57.5 
 
 		 286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  54.68 
 
 		 286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  54.09 
 
 		 300 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 		 287 aa  308  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 		 300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  52.98 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  56.43 
 
 		 287 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  50.69 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 		 296 aa  289  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  54.96 
 
 		 297 aa  288  7e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 		 282 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 		 284 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 		 285 aa  264  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 284 aa  262  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 284 aa  259  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 284 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 		 288 aa  258  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 		 284 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  46.15 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 		 287 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  47.64 
 
 		 303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 		 287 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 		 290 aa  252  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 		 285 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  45.16 
 
 		 288 aa  249  5e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.07 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  46.58 
 
 		 293 aa  246  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  47.02 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  47.96 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  45.71 
 
 		 282 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  44.05 
 
 		 316 aa  242  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 283 aa  242  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  47.78 
 
 		 298 aa  242  7e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.21 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  44.64 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  46.18 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  45.3 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  47.16 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  46.59 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  45.36 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  44.76 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  45.94 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  45.88 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 		 289 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 		 290 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 282 aa  238  8e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  44.24 
 
 		 288 aa  238  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 		 287 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 287 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3462  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2111  formyltetrahydrofolate deformylase  48.11 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  45.88 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  45.68 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  45.52 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>